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转录组测序应用
转录组
是什么,
测序
是什么,有什么用?
答:
转录组测序一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高通量测序
。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究...
转录组测序
可以
应用
到哪些研究领域上
答:
转录组所代表的是细胞或组织内全部RNA转录本(RNA transcripts),它反映着不同的生命阶段、不同的组织类型、不同的生理状态以及不同的环境条件下表达的基因。转录组的研究可以从整体水平上反映出细胞中基因的表达情况及其调控规律。随着基因组时代的到来,
转录组测序
技术将会在较为广泛的领域中得以
应用
并快速...
转录组测序
可以用来凑数据吗
答:
转录组测序
可以用于凑数据,但需要注意以下问题:1、参考基因组的质量会影响转录组的注释效果,如果参考基因组质量不高,会导致转录组注释的可变剪切和转录本数目不准确。2、转录组测序需要设置多个生物学重复样本进行分析,如果某个样品与其他样品相关性不好,可以将该样本剔除并进行差异分析。3、转录组测序...
转录组测序
是什么意思
答:
转录组测序是一种高通量测序技术,可以在单个细胞或组织中全面分析并鉴定RNA的类型、数量和序列
。这种方法可以揭示基因表达、基因调控、剪切变异等方面的信息,从而帮助我们更深入地了解细胞和组织的生物学功能。转录组测序的实验流程包括RNA提取、RNA样品制备、测序、数据分析等步骤,需要综合运用生物化学、生物...
空间
转录组
技术的
应用
答:
应用领域:
一、肿瘤生物学:1.肿瘤微环境研究:空间转录组学可以揭示肿瘤和周围微环境之间的相互作用
,帮助理解不同细胞类型在肿瘤进展中的作用。2.异质性分析:揭示肿瘤内部的细胞异质性,理解不同细胞克隆之间的空间分布。二、发育生物学:1.细胞命运决定:研究在发育过程中细胞如何根据它们的空间位置做出...
全
转录组测序
技术在兽药研究中的
应用
前景
答:
畜牧学。基因
转录组测序
技术的转录组学分析已经在猪、牛等畜种上有所运用,丰富了畜牧学的研究。转录组广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。
转录组测序
和表达谱测序的区别是什么
答:
转录组测序可以测定特定组织中全部mRNA,而表达谱测序只是测定mRNA的酶切标签序列(21 bp)。第二,代表性不同。数字表达谱测序只测定21bp序列,而转录组测序测定转录本全长,因而可以更准确地代表样品转录表达情况。第三,应用范围不同。
转录组测序应用
范围广泛,不仅可以检测表达量差异,而且可以发现新的...
罗氏454
测序
系统的
应用
答:
利用454
测序
系统测序植物
转录组
,可以得到大量的表达序列标签(Expressedsequencetag,EST)。EST是cDNA的一个片段,通常长度在150~400bp之间。研究人员可以通过连接两端有相同序列的EST,获得一个contig,直至全长cDNA序列。通过对这些EST序列与已知数据库进行生物信息学分析比较,可以进行如下研究。 1新基因发现与...
转载---[
转录组
] 转录组专题——关于样本重复性问题小技巧
答:
目前,
转录组测序
仍是
应用
最广的高通量测序技术之一,很多研究课题是关于基因表达潜在的机制,并已经发现了一些现象,但分子机制还不清楚。而做转录组测序特别适合用于分子机制探究,可以获得样本中几乎所有的mRNA信息。关于转录组领域的研究,应用范围极为广泛。如可研究同一个体不同组织之间的基因表达差异;或者不同的外界处理...
转录组测序
和单细胞测序的区别有哪些?
答:
RNA捕获方式:
转录组测序
常用的方法是全长RNA测序,将RNA转录成cDNA后进行测序。而单细胞测序往往需要使用特定的单细胞RNA捕获技术(如Smart-seq、10x Genomics等),通过分子条码标记单个细胞的RNA。数据解析粒度:转录组测序提供对整个组织或细胞系的整体基因表达情况的信息。而单细胞测序可提供每个单个细胞...
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