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转录组测序应用
转录组测序
是什么意思
答:
转录组测序
的实验流程包括RNA提取、RNA样品制备、测序、数据分析等步骤,需要综合运用生物化学、生物信息学等多学科知识。其中,数据分析是关键环节,包括对比不同组织或条件下RNA表达的差异分析、Gene Ontology富集分析等等。转录组测序技术作为生物医学研究和临床诊断的重要工具,已经广泛
应用
于肿瘤学、神经学、...
瞬息万变不过RNA——
转录组测序
常见问题集锦
答:
什么是
转录组测序
转录组测序(即RNA-seq)是RNA研究很重要的手段,研究对象为特定样本在某一功能状态下所能转录出来的RNA情况。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛
应用
于基础...
什么是
转录组
分析
答:
转录组分析指对细胞内所有转录产物的集合的分析。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。
转录组测序
一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高...
求问各位转录组分析高手,
转录组测序
与RNA-seq(quantification) 有...
答:
转录组测序
与 RNA-seq前期实验样本的处理是没有差别的,主要是测序量的不同及生物信息侧重点的不同,相对来说,转录组测序适合于大物种及基因组参考序列相对来说较差的物种,以及无参考基因组的物种,而RNA-seq 更适合于参考基因相对明确,老师只想寻找基因表达差异的物种样本,如拟南芥 等 。
什么是
转录组
分析?
答:
转录组分析指对细胞内所有转录产物的集合的分析。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。
转录组测序
一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高...
转录组测序
和表达谱测序的区别是什么
答:
转录组测序
和表达谱测序的区别:转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的基因组测序,是一个框架;表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。转录组测序和表达谱其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因...
二代
测序
原理及
应用
答:
另外还有基于胎儿游离DNA的NIPT也是二代测序在转化医学中非常经典的应用例子。随着技术的成熟,二代测序也开始应用于肿瘤游离DNA的检测,HLA的分型,病原体检测,
转录组测序
,以及甲基化测序。但是这些领域的应用,特别是对ctDNA的二代
测序应用
于肿瘤早筛,学界仍存在担忧,作者主要是提出两点:1.在正常人...
基因
组测序
在植物领域的
应用
答:
基因
组测序
在植物领域的
应用
有:基因组测序、转基因技术、分子标记辅助育种、单细胞测序技术等。一、基因组测序 基因组测序是一种通过测序技术获得一个完整的基因组序列表示的方法。通过得到植物基因组的序列,可以更好地了解植物的基因组结构和功能。基因组测序可以揭示植物间的遗传差异,解析植物基因、解释...
RNA测序与整个基因
组测序
相比有什么优势?
答:
RNA测序也就是所谓的RNA-seq,通常指的是
转录组测序
,只测细胞中的转录本。只有基因组中被转录出来的那部分能测到。通常用于寻找差异表达基因以及发现新基因。而基因组测序是整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行基因分型等。这是根本不同的两个东西,一个是测转录组,一个...
二代
测序
那些事
答:
聊一聊最常用的二代
测序
那些事:
转录组
分析进阶 20170319-第01期-Illumina测序原理 主要是看一下 : 备注:黑色区域为P7;红色区域为P5;假设P5->P7 为正向 图示如下: adapter在中文是适配器或者接口的意思,在前面的内容中已经提到将测序序列打碎成片断后要将末端补平然后添加adapter...
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