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转录组测序应用
转录
需要哪些酶的参与和这些酶的作用
答:
转录
需要RNA聚合酶的参与,这些酶的作用是催化RNA合成。在原核生物转录的过程中只有一种RNA聚合酶,催化所有RNA的合成。在真核生物中则有RNA聚合酶Ⅰ、RNA聚合酶Ⅱ和RNA聚合酶Ⅲ三种不同酶。RNA聚合酶Ⅰ存在于细胞核内,催化合成除5SrRNA以外的所有rRNA的合成;RNA聚合酶Ⅱ催化合成mRNA前体,即不均一核...
二代
测序
文库构建-概述与挑战(1)
答:
高通量测序又称NGS,重新定义了基因组学研究。近年来,NGS技术稳步发展,伴随着成本下降以及
测序应用
呈指数增加。本文,我们研究了影响测序文库质量的关键因素,以及,在DNA来源和RNA来源文库准备过程中存在的挑战。这些因素包括,DNA/RNA材料的定量和物理性质以及潜在应用(比如,基因
组测序
、靶向测序、RNA-seq、ChIP-seq、RIP...
转录组
文章 | 非生物胁迫篇
答:
研究内容: 对进行干旱处理的N22(耐旱)和IR64(干旱敏感)植物抽穗阶段组织(叶、花和根)进行
转录组测序
并比较分析。结果: (1) 发现N22的差异表达基因数量几乎是IR64的 两倍 。许多差异表达基因与 干旱相关的QTL中定位 。 这些QTL参与谷物的产量与耐旱性,也与耐旱性和关键的干旱相关植物性状...
怎么知道
测序
数据是
转录组
还是基因
答:
基因表达谱测序是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,可以用来研究基因的表达差异情况。该技术结合了
转录组测序
建库的实验方法,与转录组测序相比,基因表达谱测序要求的读长更短,测序通量更小,但仅可用于基因表达差异的研究。转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的...
二代
测序
是什么?
答:
另外还有基于胎儿游离DNA的NIPT也是二代测序在转化医学中非常经典的应用例子。随着技术的成熟,二代测序也开始应用于肿瘤游离DNA的检测,HLA的分型,病原体检测,
转录组测序
,以及甲基化测序。但是这些领域的应用,特别是对ctDNA的二代
测序应用
于肿瘤早筛,学界仍存在担忧,作者主要是提出两点:1.在正常人...
测
转录组
只能有一个物种kegg分析物种吗
答:
转录组是指某个物种或特定细胞在某一生理功能状态下,细胞内所有转录的mRNA产物的集合,包含了时间和空间的限定,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带。转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。
应用
高通量技术进行
转录组测序
是一种快捷可靠的获取转录组信息的方法。mR...
基因
测序
发展趋势是什么样子
答:
小RNA测序 二代绝对优势项目。长读长没有任何用。靶向外显子组测序 三代优势项目。不但可以直接读取全长,也可以分析大规模的结构变异与重排。
转录组测序
ISO-seq 以三代测序为代表的长读长测序方法。该测序的目的是弄清整个转录组的序列、外显子构成在基因组上的位置、可变剪切模式等。但由于三代...
单细胞免疫组库:TCR基因重排原理和TCR
测序
建库方法
答:
10X V(D)J测序与其
转录组测序
建库流程基本相同,都要经历微流控构建单细胞油包水反应体系,mRNA逆转录为cDNA并扩增的过程。与常规10X单细胞转录组测序把barcode和UMI序列放在3'端不同,V(D)J测序要把barcode和UMI序列放在5'端。 样本逆转录的cDNA经过扩增后可以一分为二,一部分做5'端scRNA测序...
全基因
组测序
技术
答:
测序文库的构建(Library Construction) 首先准备基因组(虽然测序公司要求样品量要达到200ng,但是Gnome Analyzer系统所需的样品量可低至100ng,能
应用
在很多样品有限的实验中),然后将DNA随机片段化成几百碱基或更短的小片段,并在两头加上特定的接头(Adaptor)。如果是
转录组测序
,则文库的构建要相对麻烦些,RNA片段化之后...
目前用于
测序
的技术主要有哪些?
答:
1977)发明的化学降解法。这两种方法在原理上差异很大,但都是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从而获得DNA序列。目前Sanger
测序
法得到了广泛的
应用
。
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