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转录组测序应用
单细胞
转录组测序
知识一隅
答:
单细胞
转录组测序
(Single Cell RNA Sequencing)是在单细胞水平对mRNA进行全转录组扩增及高通量测序的一种高端技术,研究单个细胞内的整体基因表达情况,以及基因的结构变异。主要用于细胞分子机制中细胞异质性研究、以及样本量少而无法进行常规高通量测序等。单细胞RNA-Seq提供成千上万个单个细胞的转录谱...
植物
转录组测序
的意义
答:
1、植物
转录组测序
的意义是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带,转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。2、转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。蛋白质...
转录组测序
和RNA-seq的区别是什么
答:
数字基因表达谱升级版(RNA-Seq)是用来研究某一生物对象在特定生物过程中基因表达差异的技术。该技术结合了
转录组测序
建库的实验方法与数字基因表达谱(Digital Gene Expression Tag Profiling, DGE)的信息分析手段,可广泛
应用
于生理调控、农业性状、生物标记、环境改造、疾病机制和药物筛选等领域。
转录组测序
和表达谱测序的区别是什么
答:
转录组测序
和表达谱测序的区别:转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的基因组测序,是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。转录组测序和表达谱其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因...
如何分析
转录组
学中的gene
答:
分析转录组学中的gene:
转录组测序
可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但由于基因与表型难以直接关联,导致关键信号通路难以确定,因此往往达不到预期研究目的。代谢物是基因型与表型之间的桥梁,代谢物的变化更能直接揭示基因的功能,因此能够更有效地揭示生物学及其生化、分子机理。在植物研究中,目前...
全长
转录
本的鉴定
答:
全长
转录组测序
(Isoform-sequencing,Iso-seq)基于PacBio单分子实时测序技术(SMRT cell),凭借超长读长的优势,建库过程中无需打断RNA分子,直接对反转录的全长cDNA测序,得到从5’末端到3’PolyA尾的高质量全长转录本序列,且目前其CCS模式可以达到超高的准确率,可用来进行转录本鉴定、融合基因、可变...
二代
测序
原理及
应用
答:
另外还有基于胎儿游离DNA的NIPT也是二代测序在转化医学中非常经典的应用例子。随着技术的成熟,二代测序也开始应用于肿瘤游离DNA的检测,HLA的分型,病原体检测,
转录组测序
,以及甲基化测序。但是这些领域的应用,特别是对ctDNA的二代
测序应用
于肿瘤早筛,学界仍存在担忧,作者主要是提出两点:1.在正常人...
转录组测序
之各类样品如何取样
答:
我们将常见
转录组测序
的样品分为五大类: 植物、动物、血液、微生物和互作类型 ,不同的类型对于取样方法和要求不尽一致,下面就一一介绍一下。1. 植物组织 :植物组织一般要求重量大于 4g。首先我们要准备好液氮预冷的无酶管,并做好取样器械的消毒和去RNA酶处理,尽量选取新鲜幼嫩、生长旺盛部位的样本...
转录组
分析怎样寻找代谢通路基因
答:
般的
转录组测序
可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但由于基因与表型难以直接关联,导致关键信号通路难以确定,因此往往达不到预期研究目的。相信很多做过转录组测序的老师都深有体会。总感觉中间缺少了一步?没错,就是代谢物!代谢物是基因型与表型之间的桥梁,代谢物的变化更能直接揭示基因的功能,...
高通量
测序
原理及技术
应用
答:
而并行测序技术则是运用多台机器对DNA分子进行同步读取以提高测序效率。第二段:高通量测序技术
应用
高通量测序技术在现代生命科学中的应用非常广泛,包括基因
组测序
、
转录组
分析、生物信息学等方面。其中,基因组测序是高通量测序技术的主要应用之一,因为它可以高效地揭示一个物种的遗传信息。此外,高通量...
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