罗氏454测序系统的应用

如题所述

第1个回答 2016-06-03

利用454测序系统测序植物转录组,可以得到大量的表达序列标签(Expressedsequencetag,EST)。EST是cDNA的一个片段,通常长度在150~400bp之间。研究人员可以通过连接两端有相同序列的EST,获得一个contig,直至全长cDNA序列。通过对这些EST序列与已知数据库进行生物信息学分析比较,可以进行如下研究。
1新基因发现与物种基因文库的构建
2 SNP 发现以及分子标记筛选
3 转录图谱的绘制
4 代谢途径的确定
5 在分子进化研究领域的应用
6 在 sRNA 发现和功能验证领域的应用

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罗氏454测序系统的测序流程答：6. 数据读取和分析工具：GS FLX系统提供三种不同的生物信息学工具对测序数据进行分析，适用于不同的应用。例如多达3Gb序列的重测序，对比已知参考序列进行的扩增产物差异分析及120Mb的从头测序工作等。罗氏454测序系统是最早出现的新一代测序系统，其应用成果在Nature，Science上发表了多篇论文。454系统自推...

罗氏454测序系统的介绍答：罗氏 454 测序系统是454 生命科学公司推出的 454测序技术，是基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统, 开创了第二代测序技术的先河。该技术是通过合成反应而测序(Seqencing-bysynthesis, SBS)的原理进行测序的。

第二代高通量测序都有哪些平台答：罗氏454平台，主要特点是测序长度很长，目前大于1K的测序没有什么难度了，比较适合基因组测序，用于搭建基因组框架，也常用于微生物基因组测序。该平台主要的错误类型是插入缺失。ABI的SoLID平台，听说该平台不在维护了，故而不再描述。Life的Ion torrent平台，目前主要有2种型号，较早的一个型号是PGM，...

高通量测序介绍答：主要包括罗氏454公司的454测序技术、Illumina公司的Solexa测序技术和 Life Technologies公司的Ion Torrent测序技术。第二代测序技术最显著的特征是高通量，一次能对几十万到几百万条DNA分子进行序列测序第三代测序：2008年开始第三代DNA测序技术是以单分子测序为特点，如Helico BioScience公司的单分子测序...

现有的测序技术有哪些,技术原理和应用有哪些。答：第一代测序：以ABI公司为代表的sanger测序，测序仪为3730.原理是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物，直到掺入一种带有荧光标记的终止核苷酸为止，通过捕获荧光来进行分析，最后得到一系列的峰图，分析可得知其序列。第二代测序就多了，罗氏为代表的454测序，illumina的solexa测序以及ABI的...

【临检杂谈】---临床检测,到底该选PCR还是NGS?(一)答：第二阶段通量为王 2005年，生命科学公司推出了基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统，即454焦磷酸测序, 开创了第二代测序技术的先河。 ABI和Illumina也不甘落后，相继推出各自的高通量测序仪。第二代测序技术成为了近十几年来，科研中最常用的测序技术，越来越多物种的全基因组图谱被绘制，...

目前最常用的第二代测序技术是哪一种答：现有的技术平台主要包括Roche/454 GS FLX、Illumina/Sol-exa GenomeAnalyzer、Helicos BioSciences公司的HeliScope™ Single Molecule Sequencer、美国Dana-her Motion公司推出的Polonator；以及连接法测序 (sequencing by ligation)，即通过引物来定位核酸信息，技术平台有Applied Biosystems/SOLiD™ ...

全基因组测序的内容答：第二代测序技术已经能够快速、低成本的进行全基因组测序，其设备供应商主要是Solexa （现被Illumina公司合并），454（罗氏公司）和SOLiD（AB公司）。第三代测序技术于2011年4月正式推广，其单分子实时（SMRT）测序技术完全不同与第二代测序，它的序列读长高达3000 bp（Pacific Biosciences 公司研发）。

分子生物学技术平台要用到哪些仪器设备答：ChemiDocXRS+凝胶成像系统、GeldocXR+凝胶成像系统等。（七）全自动核酸提取胸应用范围：采用全自动磁性分离方法对样本中病原体核酸进行分离、纯化，可直接用手PCR检测。（八）罗氏 454 高通量测序平台应用范围：用于基因组deovo测序、转录组deovo测试、宏基因组测序、重测序等。

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