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转录组测序是干嘛的
转录组
学基础——什么是RNA-seq
答:
RNA-Seq(RNA sequencing),也称为全转录组测序,
是一种利用深度测序技术来研究样本的RNA组成的技术
。这种技术能够提供关于细胞中RNA存在性和丰度的信息,可以用来鉴定和量化在特定时间点或条件下所有类型的RNA分子,包括mRNA、非编码RNA和小RNA。RNA-Seq开始于RNA的抽取和纯化。接着,通常会使用一种叫作...
转录组
转录组测序
与基因表达谱的区别?
答:
转录组测序技术是一种高通量技术,旨在测定mRNA、smallRNA以及NONcoding RNA等多种类型的RNA序列
,旨在快速全面地揭示一个物种特定器官或组织在特定状态下所有转录本的组成。它能反映出这些RNA分子的表达水平,从而提供基因活动的动态视图。相比之下,基因表达谱的构建则更为精细。它通过创建非偏性的cDNA文库...
转录组测序
和表达谱测序的区别是什么?
答:
转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序
,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。相对于传统芯片而言,转录组测序无需预先设计探针,即可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测,能够
提供更精确的数字化信号,更高的检测通量
以及更广泛的检测范围,是目前深入研...
转录组测序
和表达谱测序的区别是什么
答:
转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序
,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。相对于传统芯片而言,转录组测序无需预先设计探针,即可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测,能够
提供更精确的数字化信号,更高的检测通量
以及更广泛的检测范围,是目前深入研...
转录组测序
和单细胞测序的区别有哪些?
答:
数据解析粒度:转录组测序提供对整个组织或细胞系的整体基因表达情况的信息
。而单细胞测序可提供每个单个细胞的基因表达特征,允许研究者探索细胞类型、细胞状态、细胞亚群等更细致的分子特征。数据量和复杂性:转录组测序涉及较大的数据量,因为它通常涉及大量细胞或组织样本。单细胞测序则具有更高的数据复杂...
转录组测序
能筛选组织特异性表达的基因吗?
答:
可以筛选组织特异性表达的基因,分别对不同组织进行
转录组测序
即可,但要保证不同组织来自相同的遗传背景,比如一个个体上的不同组织,这样可以消除遗传背景的差异,谢谢。
转录组测序
和数字表达谱测序有什么区别
答:
做
转录组测序
除了可以了解到基因的表达情况,还可对测序得到的转录本进行基因结构和功能,代谢进行全面的分析。数字表达谱测序只能了解到某一物种或特定组织或器官或细胞在某一状态下基因的表达情况,上调or下降?.总之,转录组测序得到的结果更丰富。
转录组是
什么,
测序是
什么,有什么用?
答:
转录组测序一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高通量测序。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,
提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围
,是目前深入研究...
转录组测序和全
转录组测序的
区别
答:
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。
转录组测序的
研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA。转录...
RNA测序与整个基因
组测序
相比有什么优势?
答:
RNA测序也就是所谓的RNA-seq,通常指的是
转录组测序
,只测细胞中的转录本。只有基因组中被转录出来的那部分能测到。通常用于寻找差异表达基因以及发现新基因。而基因
组测序是
整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行基因分型等。这是根本不同的两个东西,一个是测转录组,一个...
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