法律分析：1.住房公积金贷款是国家政策性住房贷款，最大的不同就是利率低于银行商业贷款，职工可以节省利息支出。
2.其他还有审批速度不同。商业贷款比公积金贷款要快很多，商业贷款在借款人签订购房合同后，直接到相关银行经办机构或与银行签订合作协议的开发商处提供有关材料即可办理。
3.用途不同。商业贷款可以用来买住宅、商住，公积金贷款不能用于购买商住，只能用于买住宅、装修等。
4.贷款额度不同。一般来讲，普通购房者在办理商贷时，除自身收入情况会影响到贷款额度外，商业银行的住房贷款额度上限足够用，而公积金受缴纳人群及地区特点，对个人及家庭贷款额度是有所限制的。
法律依据：《关于利用住房公积金贷款支持保障性住房建设试点工作的实施意见》 第七条 利用住房公积金发放经济适用住房和列入保障性住房规划的城市棚户区改造项目安置用房建设贷款，贷款期限最长不超过3年；发放政府投资的公共住房贷款，贷款期限最长不超过5年。贷款利率按照五年期以上个人住房公积金贷款利率上浮10%执行，并随个人住房公积金贷款利率变动相应调整。