如果你在一家公司离职两年多，但是个人所得税上仍然显示你有发工资的记录，可能有以下几种情况：
原公司在个人所得税申报时将你的工资列入了应发工资，但实际上你并没有收到这笔工资。这种情况可能是由于原公司的人力资源部门或财务部门在操作上出现了错误或疏忽，导致记录错误。你可以先向原公司人力资源或财务部门咨询，了解他们的工资管理流程，以及是否存在类似的操作错误。如有需要，您可以要求公司出具相关证明文件，以便更好地了解该笔工资的具体情况，并对个人所得税申报进行修正。同时，您也可以咨询专业的税务机构，了解相关的税务政策，并寻求专业的指导和建议。
你离开原单位后，原单位的报税人员在自然人纳税申报系统里面设置了你的信息为非正常状态，这样你就不会在原单位出现个税申报记录了。如果还有工资纪录，说明原单位还在利用你的信息虚增工资费用用以抵减所得税，这样会导致你年终汇算多交个人所得税。你可以在个税APP提出申诉，税务机关会受理处理。
无论是上述哪种情况，建议你及时与专业人士沟通，了解具体情况，并采取相应的措施，以保护自己的合法权益。
如果你已经离开这家公司两年多了，但仍然有该公司发放的工资记录，可能有以下几种可能的原因：
工资记录出现错误：可能是因为公司的财务部门出现错误，导致工资记录没有被正确地处理或清理。你可以联系公司的人力资源或财务部门，了解工资记录的具体情况，以及如何解决这个问题。
你还有未领取的工资或补偿金：在你离开公司时，可能还有未领取的工资、奖金或补偿金等待发放。这些未领取的金额可能已经转移到了公司的财务账户中，但由于某些原因未能及时通知你。你可以与公司的人力资源或财务部门联系，核实是否还有未领取的金额。
公司没有及时更新工资记录：另外一种可能性是公司没有及时更新工资记录，导致旧的工资记录仍然出现在系统中。这种情况下，你可以与公司的人力资源或财务部门联系，要求更新工资记录。
无论出现了什么问题，你可以通过与公司的相关部门联系，核实具体情况，了解如何解决问题。如果公司有任何违法行为，你可以考虑寻求法律咨询并采取相应的法律行动。