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r语言survplot函数在哪个包
如题所述
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第1个回答 2017-03-26
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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r语言
怎么做km曲线
答:
在R语言中
绘制KM曲线,首先需要对数据进行生存分析。具体操作是使用
surv
fit()
函数
,这个函数能够计算生存函数和风险函数。完成数据处理后,使用
plot
()函数进行
绘图
,输入生存时间与事件信息,即可得到Kaplan-Meier图和KM曲线。为了使图形更加美观,还可以添加标签和标题等元素进行美化。此外,R语言还提供了一个...
KM法生存分析(二)—基于
R语言
的KM生存曲线绘制
答:
接下来,我们将使用survival包中的肺癌数据集进行分析。数据集包含患者信息与随访时间等关键变量。通过导入数据,我们能够直观地进行分析。随后,使用survfit()
函数
,对数据集进行KM生存分析,计算生存概率。完成分析后,使用gg
survplot
()函数,将KM生存曲线可视化。这一步骤使得分析结果一目了然,帮助我们理解...
R
数据可视化14:生存曲线图
答:
今天我们要用到以下几个
R包
:survival,survminer和dplyr 使用KM方法,通过 gg
survplot
作图,该
函数
作图需要两部分数据,具体见下: 1)需要什么格式的数据 我们使用的数据集为ovarian,来自survival包。该数据集来源于文章《Different Chemotherapeutic Sensitivities and Host Factors Affecting Prognosis in Advanced Ovarian Ca...
R语言
:KM生存曲线
答:
Kaplan-Meier曲线(KM曲线)是生存分析中常用的工具,它能够估计在特定时间段内的生存率。以下为相关代码示例(可直接复制):library(survival)library(survminer)aa<- read.csv('KM.csv')km2<-survfit(Surv(time1,status1==1)~BMI,data=aa)gg
survplot
(km2,pval=TRUE,pval.coord = c(0, 0.2)...
R语言
生存分析之Kaplan-Meier生存曲线
绘图
(含批量)
答:
首先,从单因素cox回归分析中筛选出影响生存预后的显著基因。然后,我们导入必要的
R包
并处理数据,数据格式需符合特定要求。以gene39为例,可以使用gg
survplot
直接绘制单个基因的Kaplan-Meier曲线。这种方法也可以批量应用,通过for循环对所有基因绘制K-M图,输出为pdf格式。批量绘图时,我们进一步优化,只对...
...两种混杂因素后,绘制c(多分类变量)的生存曲线”的
r语言
答:
R语言
绘制多因素调整的生存曲线,利用survmine
r包
中的ggadjustedcurves
函数
,可以实现对不同校正变量取值下的生存曲线进行计算和加权平均,从而绘制出多变量调整后的生存曲线。这里主要有四种方法:单一法、均值替代法、边际法和条件法。单一法计算的是整个人群的生存曲线,仅有一条;而边际法与加权方法的主要...
带直方图的限制性立方样条,基于
R语言
自带数据集,直接出图
答:
在R语言中
,我们可以使用rms库中的
函数
和数据集来创建一个具有直方图的限制性立方样条图。首先,我们需要清除工作空间并加载rms库。r rm(list = ls())library(rms)接着,我们导入自带的lung数据集,并进行一些预处理,如设定生存时间变量和状态1,以及创建生存对象。r head(lung)dd <- datadist(lung...
悬赏
R语言
作业答案
答:
#4、使用是survival软件包中的“pbc”数据集,该数据集记录的是肝硬化数据, 使用
R
完成一下要求:(软件包:survival;数据集:pbc;
函数
:
Surv
()、
surv
fit()、survdiff()、coxph()、cox.zph(), 将答案保存在“姓名.doc”文件中。)# (1)生成生存分析对象,拟合生存曲线模型。install.packages("survival") #安装...
R语言
使用 ggscidca包优雅的绘制竞争风险模型决策曲线
答:
ggscidca包绘制的决策曲线基于stdca.
R函数
,该函数是竞争风险模型分析的基础,尽管与dcurves包的结果有所不同,但通过对比分析,作者认为ggscidca包的实现更为准确。总之,ggscidca包为竞争风险模型决策曲线的绘制提供了一个实用且灵活的工具,帮助临床决策者更好地评估模型在实际应用中的效果。
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