我要研究的一个基因有多种转录变体（transcript variant），如何设计引物来分析基因的表达情况？

Question

如题所述

Answer 1

具体的中文怎么表达我不清楚，不过mRNA有transcript variant 表明最终翻译表达的蛋白可能有不同的isoform，这些isoforms有同样的名称，他们的基因名称一样。比如一个m基因，它的mRNA有2个transcript variant ：transcript variant 1和transcript variant 2，表达的蛋白是M，有两个isoforms，分别是 M isoform 1和M isoform 2（也许会有通用的不同后缀，如α，β等）。它们也许在功能上作用相似，或不同，要查具体的资料才知道。要看你的具体需求确定需要哪个transcript variant ，或者直接找所有transcript variant 的相同序列（如果是设计引物的话）。不知道这个答案能不能帮到你。

Answer 2

如果是针对总的基因表达产物，可以寻找变体的共有序列（common sequence）——针对共有RNA序列的特异性探针和针对共有多肽序列的特异性抗体，分别用于检测mRNA表达水平和蛋白质水平。
如果是想检测某个剪接变异体，可以针对其特有序列设计探针、制备抗体。

Answer 3

看看这个基因在你的细胞中的表达情况。追问

就是不知道表达情况才要做的呀。我就想问，我是不是要把所有变异体都做了得出的结论才有意义。

Answer 4

探针法行吗