基因的Transcript Variant 和 isoform的区别如下：
transcript variant是从结果来看的，一个基因产生了不同的mRNA；splice variant是从过程讲的，强调内含子剪切的方式不一样。
variant指的是转录本的亚型，而isform指的是蛋白水平的。有的时候虽然variant很多但是对应的蛋白可能是重复的。
有很多过程可以影响isoform的形成，如可变剪切，即不一定所有的外显子都用来形成成熟的mRNA，而且有时候什么内含子，外显子也不是绝对的。另外有RNA editing这个过程，会使得形成mRNA时某个特定的位置的碱基发生变化，也就是变成不是原来基因想要编码的东西。
有个例子就是一个叫XBP-1的转录因子，它调控细胞的unfolded protein response，激活方式就是上游蛋白剪切其mRNA然后生成有活性的mRNA，所以这种variant的生成竟然也是调控的一种方法。