两个独立法人核算公司无偿调拨固定资产是要交税的。
《增值税暂行条例实施细则》第四条规定，单位或者个体工商户的下列行为，视同销售货物：
（一）将货物交付其他单位或者个人代销；
（二）销售代销货物；
（三）设有两个以上机构并实行统一核算的纳税人，将货物从一个机构移送其他机构用于销售，但相关机构设在同一县（市）的除外；
（四）将自产或者委托加工的货物用于非增值税应税项目；
（五）将自产、委托加工的货物用于集体福利或者个人消费；
（六）将自产、委托加工或者购进的货物作为投资，提供给其他单位或者个体工商户；
（七）将自产、委托加工或者购进的货物分配给股东或者投资者；
（八）将自产、委托加工或者购进的货物无偿赠送其他单位或者个人。
根据上述规定，实行独立核算的二级及三级纳税人的机构间移货，不适用上述第四条第（三）项规定；“设有两个以上机构但自行独立核算的”，资产移动是否需要视同销售，根据细则第四条其他条款判断。即是否发生代销、投资、分配、赠送行为，同一法人下属分公司调拨固定资产，如果是无偿赠送，则要视同销售货物处理。
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