疫区（quarantinearea）是指由官方划定的发现有检疫性有害生物存在，并正由官方采取措施控制中的地区。因此，一旦发现有政府确定的检疫性有害生物危害，并经过政府认定之后，应该由政府宣布。同时，该疫区就应由政府采取相应的检疫措施加以控制，不让疫情发展。当特定的检疫性有害生物被铲除或扑灭以后，经专家认定，再由政府宣布撤消。疫区可以是一个国家的全部或部分地区，也可是几个国家的全部或部分地区。近年来，由于贸易自由化及促进本国农产品出口的需要，根据疫区内特定有害生物发生、危害的程度又将疫区进行进一步的细分，先后出现了有害生物低度流行区（areaoflowpestprevalence）、缓冲区（bufferzone）、控制区（controlledarea）、保护区（protectedarea）、非疫产地（pestfreeplaceofproduction）和非疫生产点（pestfreeproductionsite）等新的植物检疫概念。
有害生物低度流行区主要依据特定有害生物发生危害程度来确定。它是指经主管当局认定，某种有害生物发生水平低，并已采取了有效的监测、控制或根除措施的地区。这个概念的出现为非疫产地和非疫生产点（区）的建立提供了依据，也符合植物有害生物流行学的基本规律。控制区专指国家植物保护组织确定为防止特定有害生物从疫区扩散所必需的最小的限定区域；国家植物保护组织为有效保护受威胁地区而确定的必需最小的限定区域则称为保护区，两者针对的对象不同。受威胁地区是指生态因素适合某种有害生物的定殖，该有害生物的定殖将会造成重大经济损失的地区。