三尖瓣下移畸形的发病机理主要由三尖瓣的异常关闭程度决定，包括瓣叶的不全以及伴随的心房间隔缺损等因素。这种情况下，三尖瓣的关闭不全会导致房室环和右心室的扩大，瓣叶变形等病理变化。在心脏的收缩和舒张过程中，右心房在收缩时，由于房化心室的参与，血液流入右心室的量并不充分，使得右心房血液容量增加，房腔扩大，进而引发心力衰竭。
在伴有卵圆孔未闭或心房间隔缺损的病例中，右心房的压力高于左心房，导致血液从右向左分流，体循环动脉血的氧含量下降，表现出紫绀和杵状指（趾）的症状。如果房间隔保持完整，右心室收缩时，进入肺部进行气体交换的血流量减少，使得动静脉血氧差变小，可能会出现面颊潮红，以及指端轻微紫绀的现象。这些病理变化共同作用，构成了三尖瓣下移畸形的临床表现和影响。
三尖瓣下移畸形是一种罕见的先天性心脏畸形。