由于指纹的特殊性，故而现在的很多文件签字、画押等都需按手指印，但按指印可不是我们现代人的“专利”，在一古装些电视剧中也经常看到很多签字画押的情形，签完名和日期后，在上面盖上手指印，古代没有指纹技术，也就是不能识别这个指纹是谁的，要是签字人不承认是自己做的，签字画押不等于是做无用功吗？如果这样想那就太低估古人的智慧了，事实上古人也是有“指纹技术”这一门“黑科技”的。那么古人都在哪方面应用了指纹呢？
古人很早就懂得了指纹对比，并开始运用到了案件审查上，虽然精准度比不上今天的指纹识别器，但在当时却是非常靠谱的一个方法了，据记载，秦朝便开始运用指纹来破案，秦朝的《封珍式-穴盗》中记载：“内中及穴中外壤有膝、手迹、膝、手各处”。这是有记录的最早运用指纹破案的记录，古人对指纹的分析很简单，简单来说就是肉眼辨别，古人将指纹分为两类，即“螺”和“箕”。“螺”是漩涡型指纹，呈螺旋状，“箕”是流状指纹，每个人的指纹的节点都会不同，通过对别，不难得出结果。
宋元时期是指纹查案的一个新高度，北宋的元绛是这方面的行家，北宋有个叫周整的人喜欢赌博，家里有不少上等田，这些田被一个叫龙聿的恶霸看上了，便诱惑他赌博并出老千赢了他，利用周母的旧文术伪造田契，但有个破绽，就是日期写在指纹之上了，周母知道后告到官府，但官府并未发觉这个破绽，所以驳回了周母的诉求，元绛任县官之后，经过仔细察看，发现了其中的破绽，最终保住了周家的“命根子”。
宋朝的提刑官宋慈在这方面也是个行家，“法医”出身的他，被称为“古代十大断案高手”，一生的著作《洗冤录》，里面详细记载了如何运用指纹来破案。
还有就是古代人按拇指一般是用拇指，这就成了一个漏洞，一些罪犯利用这个不成文的规定，在指纹对比之前就“忍疼割爱”，把拇指切掉了，没有了对比，奈我如何，但所谓“魔高一尺，道高一丈”，“上有政策，下有对策。”后来就规定用手掌或脚掌来画押，这一招可谓是断了罪犯的后路，总不能把自己的脚掌、手掌都砍了吧？还没开始审案，自己便“损兵三千了。”宋元时期的案件结束亦需“点指画字”。
指纹的应用是我国古代劳动人民智慧的结晶之一，西方直到十七世纪才发现指纹的特殊性，整整比西方早了2000年，是我国古代人民贡献给世界的又一大“专利”。