对大脑有危害，对消化系统有危害，容易导致肥胖。
一、对大脑的危害
虽说脑组织的重量只占人体重的2－3%，但脑的血流量每分钟约为800毫升，耗氧量每分钟约为45毫升，耗糖量每小时约为5克。青少年的脑组织正处于发育期，血、氧、葡萄糖的需求量比成人还高。
二、对消化系统的危害
正常情况下，头天晚上吃的食品经过六小左右就从胃里排空进入肠道。第二天若不好吃早餐和午餐，胃酸及胃内的各种消化酶就会去消化胃粘膜层。长此以往，细胞分泌粘液的正常功能就会遭到摧毁，很轻易造成胃溃疡及十二指溃疡等消化系统疾病。
三、造成动脉硬化且更易导致肥胖。有不少青少年学生是怕长胖而不吃午餐的。这种做法毫无科学道理。人体对热量的需求是有标准的，不吃午餐，势必加大晚餐的进食量。而晚餐后一般运动量较小，更轻易造成脂肪积存而导致肥胖。另外，长期不吃午餐还会使胆固醇、脂蛋白沉淀于血管内壁，导致血管硬化。