采用基质无土栽培时，对基质选择与配制需根据栽培方式来考虑适用性和成本问题。对基质总的要求是容重轻、孔隙度较大，以便增加水分和空气含量。基质的相对密度一般为0.3克/立方厘米～0.7克/立方厘米，总孔隙度在60%左右，化学稳定性好，酸碱度接近中性，不含有毒物质。有些基质可单独使用，但一般以2种～3种混合为宜。良好的基质应适合多种作物的种植，不能只适合于一种作物。
目前，我国无土栽培生产上应用效果较好的基质配比有1∶1的草炭、蛭石（锯末），1∶1∶1的草炭、蛭石、锯末（珍珠岩），6∶4的炉渣、草炭等。草炭仍然是目前最好的基质，在混合基质中一般占35%～50%。
基质混合时，如果用量小，可在水泥地面上用铁铲搅拌均匀，量大时用混凝土搅拌机混合。干燥的草炭不易渗水，每立方米草炭可用40升水加50克次氯酸钠，以利于快速湿润。
基质中加入固体肥料的配方为：0.75立方米草炭+0.13立方米蛭石+0.12立方米珍珠岩+3千克生石灰+1千克过磷酸钙+1.5千克三元复合肥（1∶1∶1）+10千克消毒干鸡粪+0.5千克乙二胺四乙酸铁+0.5千克微量元素。