新生儿医保的报销比例：1.门诊待遇：在市区定点医疗机构(不包括定点零售药店)就医，1000元限额内享受50%的医疗补助。2.住院待遇：每次住院起付标准以内的医疗费用由个人负担。每次住院起付标准为500元。起付线以上至4万元(含)的部分基金结付75%;4万元以上至10万元的部分基金结付80%;10万元以上至20万元基金结付90%。3.门诊特定项目医疗待遇：患尿毒症透析、器官移植抗排异.、恶性肿瘤、再生障碍性贫血、血友病和重症精神病的参保少儿，在办理门诊特定项目登记后，可以享受相关门特殊待遇。
法律依据：《社会保险法》第二十六条：职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
《社会保险法》第二十八条：符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
《社会保险法》第二十九条：参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。