南京的研究生院校包括：
1. 南京大学
南京大学是南京的一所综合性重点大学，设有多个研究生培养院系，涵盖了文、理、工、管、法、医、教育等各个领域。
2. 东南大学
东南大学是工程科技类的高水平大学，其研究生教育在国内外享有较高声誉，特别是在电子信息、交通运输、生物医学等领域有突出优势。
3. 南京航空航天大学
南京航空航天大学在航空航天技术、机械工程等领域有深厚的科研实力，为国内外培养了大量的高层次研究生。
4. 南京理工大学
南京理工大学是一所以理工科为主的高等学府，其研究生教育在材料科学、化学工程、电子信息等领域颇具影响力。
5. 河海大学
河海大学在水利工程领域具有独特的优势，其研究生教育在水利工程学及相关学科领域具有很高的学术水平。
此外，南京还有许多其他高校如南京医科大学、南京师范大学等也提供研究生教育。这些学校在不同的学科领域都有各自的优势和特色，为南京乃至全国培养了大量的高层次人才。南京作为中国的教育和科研重镇，拥有众多高水平的研究生院校，为广大学子提供了丰富的选择。