云南发现野生辣椒,经国家有关专家组调查研究确认,云南野生辣椒是中国原产辣椒无疑,另外,古代文献中,较早就食用辣椒了,尤其从先秦到两宋,有更多详尽的种植、食用、药用辣椒植物的记载。《诗经·陈风·东门之枌》云:“视尔如荍,贻我握椒。”陈子展《诗经直解》理解为花椒。但是《计然》一书中曾说“蜀椒出五都,秦出天水”,《中药大辞典》就列辣椒为秦椒。《山海经·北山经·景山》云:“又南三百里,曰景山,南望盐贩之泽,北望少泽。其上多草、藷藇,其草多秦椒”关于泰椒所指何物?晋郭璞曾注“子似椒而细叶,草也。”按这个说法,景山之秦椒显然不是花椒(是早期称谓影响了后世的认知)。苏轼《春菜》诗中有:“细履幽畦掇芳辣,”辣椒是种在畦里,况且花椒是春天不能采摘的,这里显然足指的辣椒,四川人爱好辣味,故称辣椒为“芳辣”。
20世纪70年代,在云南西双版纳丛林中有人发现了野生和原生态的小米辣。2006年,南京农业大学的一些科研人员对21份中国辣椒、8份美国辣椒、1份墨西哥辣椒和1份智利辣椒做了DNA分析,其中包括云南的小米辣椒样本。研究者发现,云南灌木状辣椒和美洲灌木状辣椒的DNA指纹之间的"相似系数"甚低,中国云南西双版纳C.frutescens种质与美洲C.frutescens种质具有较大的扩增片段差异。因此,云南和美洲的灌木状辣椒应当是在人类驯化之前分化而出现的。研究者早已得出了西双版纳地区"可能是辣椒起源地之一"的结论。实际上不止此品种线索,还有其它待证据充分,即符合国际相关证据条件。