报关程序包括三个阶段：
减免税申请（货物进口之前的前期阶段）——进出口报关——申请解除监管（后续阶段） 1、特定地区（①保税区减免税货物、②出口加工区减免税货物）
（1）保税区减免税货物
备案登记
向海关办理减免税备案登记时，应提交：
①、企业批准证书
②、营业执照
③、企业合同
④、章程
海关审核后准予备案的，签发企业征免税登记手册。
申领“进出口货物征免税证明”
在进口特定减免税货物以前，向保税区海关提交企业征免税登记手册、发票、装箱单等，录入海关计算机系统。核发“进出口货物征免税证明”
（2）出口加工区减免税货物
备案登记
向海关办理减免税备案登记时，应提交：
①出口加工区管理委员会的批准文件
②营业执照
海关审核后批准建立企业设备电子帐册。
申领“进出口货物征免税证明”
在进口特定减免税货物以前，向出口加工区海关提交发票、装箱单等，海关在电子帐册中进行登记，不核发“进出口货物征免税证明”。 （主要是指外商投资企业）
备案登记
向海关办理减免税备案登记时，应提交：
①、商务主管部门的批准文件
②、营业执照
③、企业合同
④、章程
海关审核后准予备案的，签发“外商投资企业征免税登记手册”。
申领“进出口货物征免税证明”
在进口特定减免税货物以前，向保税区海关提交：外商投资企业征免税登记手册、发票、装箱单等，经海关核准后，签发“进出口货物征免税证明”。 （1）国内投资项目减免税申请
国内投资项目，经批准后，凭国家鼓励发展的内外资项目确认书、发票、装箱单等向主管海关提出减免税申请。海关审核后，签发“进出口货物征免税证明”
（2）利用外资项目减免税申请
利用外资项目，经批准后，凭国家鼓励发展的内外资项目确认书、发票、装箱单等向主管海关提出减免税申请。海关审核后，签发“进出口货物征免税证明”
（3）科教用品减免税进口申请
备案登记：
办理科学研究和教学用品免税进口申请时，应当持有关主管部门的批准文件，向主管海关办理资格认定手续。海关审核后，签发“科教用品免税登记手册”。
申领“进出口货物征免税证明”
在进口特定减免税科教用品以前，向主管海关提交科教用品免税登记手册、合同等单证。经海关核准后，签发“进出口货物征免税证明”。
（4）残疾人专用品减免税申请
①向主管海关提交民政部门的批准文件，海关审核后，签发“进出口货物征免税证明”。
②民政部门或中国残疾人联合会所属单位批量进口残疾人专用品，出具民政部门或残联（包括：省、自治区、直辖市的民政部门出具）出具的证明函，海关凭以审核签发“进出口货物征免税证明”。 （1）有效期6个月
（2）“一证一批”的原则
