不好这么笼统的说，蛋白质的种类太多了，有的是溶于水的，有的是不溶的，取决于蛋白质的结构和功能。
大多数的
球蛋白是溶于水的，因为它们的疏水基团常常是形成三维结构的主要核心，通过疏水塌缩形成球状结构，而外周的氨基酸就大多数是亲水的，和水形成氢键。
维持结构的蛋白一般是不溶于水的，如果它们溶于水的话，在细胞里面就溶掉了，还怎么维持
细胞结构呢。
跨膜蛋白估计难溶于水的，即使溶了也不是天然构象了，因为它们的跨膜区域是在
脂质双分子层中间的。脂质尾巴是疏水的，那么这些跨膜蛋白的相应区域也应当是疏水的，它才能够镶嵌在膜中。
总而言之，蛋白质是否溶于水取决于它天然结构表面的
氨基酸残基是否亲水，如果绝大部分是亲水的极性残基，它就是能溶于水的。