一、培养方向不同
学制两年研究生主要是为特定的行业培养优秀的实践型人才；而学制三年研究生主要是培养理论性人才，注重培养学生的教学和科研能力。
二、招生条件不同
学制两年研究生要求报考学生必须有一定的工作经验，并且报考人员需要征得所在单位的同意，否则不能报考；而学制三年研究生则没有这些要求。
三、招生考试不同
学制两年研究生每年有两次考试的机会，一次是10月份的联考，另一次是年初的统考，考生可以根据自己的时间安排参加哪次考试。并且这两个考试都是由招生单位自主命题、自主批改试卷的；而学制三年研究生只有年初的统考，统考以外的专业课是由招生单位自主命题的。
四、学习方式不同
学制两年研究生通常是半脱产研究生，学制是2-3年；而学制三年研究生通常是全日制学习研究生，学制是3年。
五、学习费用不同
学制两年研究生的学费通常由学生自己负责，并且各个院校的收费标准不一样，学生要以报考院校的具体规定为准；而学制三年研究生是国家统一拨款资助的，通常不需要学生自己交学费，并且在校期间可以享受奖学金和生活补贴的福利。
六、文凭颁发不同
学制两年研究生只可以获得学位证书，不可以获得学历证书。但是有一些专业是有例外的，比如工商管理硕士、法律硕士、临床医学硕士，这几个专业可以获得学历证书；而学制三年研究生成绩合格毕业后，都可以获得学历证书和学位证书。
扩展资料：
从总体情况而言，学硕难度大于专硕。从专业课上看，学硕对考生的专业基础、专业深度要求较高，因为以后要从事学术研究，在这方面要求比较高。
从英语方面来看，学硕考英语一，专硕考英语二。两种试卷的题型差不多，但是考试难度差很多，英语一的难度要远远大于英语二。
综述：考试难度不一样：
2年制研究生也叫专业型研究生，更加注重专业的培养，3年制研究生也叫学术型研究生，更注重学术上的培养，2者培养方向完全不同，当然考试难度也就不同，个人觉得3年制的考试难度上要更大一些，因为学术研究涉及面更广。
学制，即学校教育制度，是国家根据教育方针、政策，对各级各类学校的任务、学习年限、入学条件等所作的规定。它是教育制度的主体，是现代教育制度的核心内容。有时专指各级各类学校的学习年限。
现代学制有三种基本类型：
双轨学制（一轨是普通学术教育，另一轨是职业教育)、单轨学制、分支型学制。
参考资料来源：百度百科－学制
必须提醒的是，专业硕士毕业后和学术性拿到的毕业证书是一模一样的。但是学位的话，请注意了，不是“专业硕士”这四个字眼！而是分类的，专业硕士是个统称。它包括“工程硕士，建筑学硕士，法律硕士，临床医学硕士”等等。所以根据你的专业，拿到的学位就是相对应的。比方说你是“结构工程”的专业硕士，那么你拿到的学位上面的字眼就是“工程硕士”。你是建筑学的专业硕士，那你拿到的就是“建筑学硕士”！不是“专业硕士”字眼！！特此提醒！ 学术性的话，学位证书就是“工学硕士”等等！
从学制来说，专业硕士一般只要求2年即可毕业，其中不少于半年的实习期，重视操作能力；而学术型基本上以学习理论为主，学制一般为3年。
专硕和学术型硕士（科学型硕士），在校的主干课程基本上是完全一样，生活、学习与导师培养方式等等都没太大区别！
在校期间有五点区别的是：1、三助申请的岗位有区别，专硕的比较少；2、奖学金，同样有A、B类。学术型的每个人都有奖学金，而专硕型，只有部分人有。也就是说有一部分人要自己出全部学费、（其实这是和学校有关系的，比方说武大，上海交大的专硕是全部有奖学金的。同济特例！）；3、专硕研二要外出实习半年。这是必修的课程。（但是如果导师有项目就不要出去了，可以跟着导师做）；4、毕业论文，专硕既可以做学术型的论文，也可以做工程实例型的；5、专硕不能直博，考博正常。
至于就业，由于现在第一届全日制应届考取专业硕士的研究生还没毕业，所以，没办法说谁好就业。不过，就我感觉，专业硕士以后是主流，而且重实际能力也适合企业选拔人才的需
目前我国高校普遍存在着两年制和三年制两种硕士研究生培养模式。数学、文学等学术型硕士培养时间通常为三年，而法律硕士等专业型硕士培养时间为两年。