常用的无土栽培选用的基质：水用水作基质的栽培方式叫水培，这里的水，兼有基质、营养物质及溶解媒体的三种作用。因此，水质的好坏直接影响着无土栽培的成败，以选用洁净的中性水做基质为宜，不宜使用含氯化钠的水和水质过硬的水，不能使用碱性水，更不能使用含有油污或受到大气污染的水。
沙和砾石可以选用直径介于1毫米和3毫米之间的沙粒，或直径大于3毫米的砾石。两者的理化性状均稳定，随处可找到。颗粒越小，保水性越强。要选择坚硬不易破碎的，但却不要选用含石灰质过多的，否则易使溶液偏碱性，使铁元素被固定。
蛭石为云母类的次生矿物，经加热膨胀爆裂后形成小的、海绵状的片状核。呈中性反应，不溶于水，具有很好的缓冲性，同时具有良好的透气性和保水、保肥性。多数蛭石含有效钾为5%～8%、镁9%～12%，因此，蛭石是一种理想的基质。但吸水膨胀后的蛭石不能挤压，以免破坏它的多孔结构。
珍珠岩系硅酸盐矿物经1000℃高温膨胀破碎而形成轻的海绵状小颗粒。它能保持比本身重3～4倍的水，但无缓冲作用，与蛭石不同，珍珠岩不含矿物质营养成分，化学性状稳定，通透性能好，常与蛭石等基质混合使用。
对于长期使用的基质，易孳生病菌为害花苗，故每次栽后都要注意进行消毒处理。一般可用1%的漂白粉液，将基质浸泡约半小时，然后再用清水将基质冲洗干净，便可重新使用。