当购买新车后，如在购买后的两个月内发动机出现问题，是否能申请更换？答案是肯定的。根据《家用汽车产品三包规定》，自购车发票开具之日起六十日内或行驶里程达三千公里（以先到为准），若发动机、变速器的关键部件出现质量瑕疵，消费者有权免费更换这两部分。重要的是，哪些部件被认定为关键零件由生产者明确标注在三包凭证上，且需符合国家相关标准，具体细节由国家质检总局进一步明确。
三包政策是保护汽车消费者权益的核心法规，涵盖产品质量、维修及退换货等多个方面。在三包政策中，对发动机和变速器等核心部件的更换有明确规定。如果发动机在短时间内故障，消费者有权向销售商提出更换申请。更换时，需出示购车发票和三包凭证，并在规定期限内执行。消费者也可直接向制造商提出，但需提供相关证据。
在实际操作中，若要更换发动机，首先需对故障进行检测。如果故障源于发动机或变速器关键部件，消费者可依据三包政策执行更换。然而，如果故障不涉及关键部件，可能需要根据具体情况选择维修或更换。在选择维修厂时，消费者务必选择正规机构，避免因维修不当带来的二次问题。同时，积极与销售商或制造商沟通，寻求最佳解决方案。
综上所述，对于购车后两个月内发动机故障的情况，消费者有权依据三包政策要求更换，务必遵循规定程序，提供相关证明，并选择正规维修渠道。同时，通过与相关方交流，确保获取最佳的解决方案。
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