1548年，嘉兴知府赵瀛组织疏浚城河，将挖出的河泥填入南湖中，成一“厚五丈，广二十丈”，面积约17亩的湖心小岛，四面环水，俗称“湖心岛”。
1549年，赵瀛依烟雨楼原貌将其从湖畔迁建到了湖心岛上，从此形成了湖中有岛、岛中有湖的独特景观。从此这里被称为“小瀛洲”，素以“微雨欲来，轻烟满湖，登楼远眺，苍茫迷蒙”的景色著称于世。
10年过后，烟雨楼“为风雨之所摧也最甚”。1581年，刚到嘉兴上任的嘉兴知府龚勉与朋友、同事登临烟雨楼时，见“楼已圮不可登”，不禁喟然感叹说：“此郡之大观也，岂宜久湮？”
于是，1582年，龚勉主持重修了烟雨楼的工程。“楼仍其朴，而易其材，务令可久。”他把沈奎之前垒在楼前的石台增高，并列级而降，以便临湖垂钓。
与此同时，他将该石台命名为“钓鳌矶”，亲自写下了“钓鳌矶”3个大字，刊成石碑，嵌在石台之下，以示期望嘉兴府城中的读书人，在进京赴试时都能得中功名，独占鳌头。
1583年，龚勉又在南湖湖心岛上建了瀛洲十二胜景。瀛洲是传说中的东海仙山，与蓬莱、方丈并称“三神山”，上有仙人及长生不死之药。
站在烟雨楼上，可“左凭郊野，诸园亭榭，近列槛前。右俯城郭，华屋万家，毕入望内。其环湖以居者，又相为映带，而湖波浩涉，一望烟雨杳霭，恍然蓬瀛也。”，所以，龚勉把烟雨楼周围景色命名为“瀛洲十二胜景”。
重修之后，“楼之胜益奇”，龚勉大概对此事也十分自得，他欣喜之余，亲自写了一篇《重修烟雨楼记》以记其事。此外，他还著有《烟雨楼志》4卷，但该书已经失传。
龚勉在嘉兴知府任上多有惠政，他重修了烟雨楼，恢复了名胜古迹，并且开浚城河，便利农田灌溉，方便舟船往来，做了一些对百姓有益的事情，民众大为称赞。