R语言complexheatmap包详细介绍（3）

Question

如题所述

Answer 1

继续深入学习 complexheatmap 包的内容，这是系列的第三篇文章，内容丰富，将通过一系列推文逐一介绍。欢迎关注我的公众号：医学和生信笔记。

本系列是 complexheatmap 包的学习笔记，部分内容基于个人理解进行了适当调整，但总体不影响原文。如有疑问，请参考原文。原始资料请见：jokergoo.github.io/Comp...

注释条在热图中至关重要，可以放置在热图的上下左右，通过 top_annotation、bottom_annotation、left_annotation、right_annotation 设置。所有注释条由 HeatmapAnnotation() 函数完成，rowAnnotation() 可视为变体，通过设置 HeatmapAnnotation(..., which = "row") 实现。

热图中注释条的使用包括但不限于改变位置、颜色映射、处理 NA 值、改变样式、使用数据框或矩阵。简单注释条是最常见的形式，颜色映射数值，需要向量和名称。可以通过修改颜色映射、同时添加多个简单注释条、处理 NA 值、调整样式、使用数据框或矩阵以及控制简单注释条的高度来实现。

注释条还可以作为函数使用，通过 foo = 1:10 实现，可以添加更多的样式，如改变高度。空注释条和注释条分割是额外的选项，增加更多样式，复杂用法可能需要编写自定义函数并了解 grid 绘图系统。

此外，图形注释条是一个高级选项，但可能需要额外的技能才能成功应用。点状注释条则是热图中的另一类注释条，提供了额外的可视化选项。

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