主要区别有，换热来源不同、工作原理不同、安装使用不同，具体如下：
一、换热来源不同
1、风冷冷水机
换热的来源是气体，配备的有专用电扇，故称为“风冷”。
2、水冷冷水机
换热的来源是水，配备的有专用冷却塔，故称为“水冷”。
二、工作原理不同
1、风冷冷水机
风冷机是直接由空气被机械地传阅，机器的冷凝盘管，直接驱逐热量大气空气冷却。
2、水冷冷水机
通过冷却塔和水泵，用以抽取热水进行散热，使制冷过程能够循环进行。
三、安装使用不同
1、风冷冷水机
可移动，无需其他辅助。
2、水冷冷水机
外部需配水塔和水池，方可使用。
参考资料来源：百度百科-风冷冷水机
参考资料来源：百度百科-水冷冷水机
参考资料来源：百度百科-水冷型工业冷水机
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水冷式冷水机：
水冷式冷水机组具有与冷却塔相连的水冷冷凝器。它们通常用于供水充足的中型和大型装置。由于环境温度的波动相对独立，因此水冷式制冷机可为商业和工业空调提供更稳定的性能。水冷式冷水机组的尺寸从20吨的小型机型到几千吨的机型不等，这些机型可以冷却世界上最大的设施，如机场，购物中心和其他设施。
典型的水冷式冷却器使用来自冷却塔的循环冷凝器水来冷凝制冷剂。水冷式冷水机组包含的制冷剂取决于进入的冷凝器水温（和流量），该温度与周围湿球温度有关。由于湿球温度始终低于干球温度，因此水冷式冷水机中的制冷剂冷凝温度（和压力）通常会明显低于风冷式冷水机。因此，水冷式冷却器可以更有效地运行。
风冷式冷水机组：
风冷式制冷机依靠由环境空气冷却的冷凝器。因此，风冷式冷水机可能会在可能存在空间限制的小型或中型设备中找到常见的应用。在水代表稀缺资源的情况下，风冷式冷水机是最实用的选择。典型的风冷式冷水机可以采用螺旋桨式风扇或机械制冷循环，以在翅片盘管上吸入环境空气以冷凝制冷剂。
气冷式冷凝器中制冷剂蒸气的冷凝使热量能够传递到大气中。风冷式冷水机具有降低安装成本的显著优势。与水冷式冷却器相比，由于维护相对简单，因此维护也更简单。风冷式冷水机将占用较少的空间，但大多数将位于设备外部。
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风冷式工业冷水机：
风冷式工业冷水机是利用壳管蒸发器使水与冷媒进行热交换，冷媒系统在吸收水中的热负荷，使水降温产生冷水后，通过压缩机的作用使热量带到翅片式冷凝器，再由散热风扇散失到外界的空气中(风冷却)。
水冷式工业冷水机：
水冷式工业冷水机是利用壳管蒸发器使水与冷媒进行热交换，冷媒系统在吸收水中的热负荷，使水降温产生冷水后，通过压缩机的作用将热量带至壳管式冷凝器，由冷媒与水进行热交换，使水吸收热量后通过水管将热量带出外部的冷却塔散失(水冷却)。
风冷冷水机与水冷冷水机的区别：
风冷式工业冷水机和水冷式工业冷水机两者的区别主要在于冷凝器的不同。风冷式工业冷水机采用风扇做为散热。通常采用翅片式的冷凝器，翅片其实是指铝片，即将需要换热的部位采用外部安装铝片，以达到高效散热，再通过强力风扇将热气抽出。与风水冷式不同，水冷式工业冷水机的冷凝器主要通过循环冷却水来带走热量，因此水冷冷水机的冷凝器也通常称为水炮。