厦门大学生物医学研究院的科学研究聚焦于两个核心课题：代谢性疾病和乳腺癌细胞扩散的基因调控。
首先，针对糖尿病和肥胖症，中心致力于天然小分子药物的研发。Shp2，作为这两种疾病的关键调控基因，其活性对疾病发展有显著影响。尽管中草药有悠久的糖尿病治疗历史，但其成分不明导致疗效受限。研究院利用先进的技术，从天然产物中分离提纯出小分子，并结合shp2活性分析系统，筛选可能的抑制剂或促进剂。通过细胞实验、转基因动物模型以及动物疾病模型，逐步验证这些小分子的作用，以期将研究成果转化为临床药物。
其次，乳腺癌细胞扩散的研究同样引人关注。这一研究旨在揭示细胞扩散的调控机制，特别是lmo4和gab2等基因的作用。团队将深入研究这些基因的调控途径，构建药物筛选系统，结合天然小分子资源开发新型抗癌药物。同时，通过收集病理样本和数据，利用生物信息学技术，监测和分析乳腺癌细胞扩散中的基因表达变化，以期发现更多关键的调控基因，深化对乳腺癌扩散机制的理解。
厦门大学生物医学研究院成立于2006年厦门大学85周年校庆之际。生物医学研究院是厦门大学直属研究机构，研究院下设6个研究中心：癌症研究中心、细胞生物学及传染性疾病研究中心、代谢性疾病研究中心、神经退行性疾病及衰老研究中心、转化医学研究中心和天然产物化学研究中心。