什么是生物的系统进化？越详细越好！

Question

如题所述

Answer 1

进化分类学派以麦尔（May）、辛普森（Simpson）等人为代表。这一学派基本接受支序学派通过支序分析重建系统发育的方法（即支序分析方法）。支序分类学派和进化分类学派是当今动物分类学界的主流，两个学派之间的分歧在以下几个方面；
1）进化分类学派认为建立系统关系时，单纯依靠血缘关系（即分支的顺序，不能完全概括在进化过程中出现的全部情况。尚需考虑到各分支之间的进化程度。
2）进化分类学派认为凡起源于一个共同祖先的类群，均为单系群或单源群。
3）在方法论上，进化分类学派认为生物分类学家的工作是要分出动物的实际具体类群，支序学派的方法带有过多的形式逻辑成分，先验性太强。
4）在分类系统的安排上，进化学派指出支序学派的做法中，编级的层次太多，致使系统过于臃肿，在实践中无法使用。
A. 两栖类起源于古总鳍鱼，最早的两栖类是坚头类（鱼头螈）距今3.5亿年前的泥盆纪晚期，由于气候与地壳原因时大量的鱼类（肺鱼与总鳍鱼）要到陆地上生活。现代两栖类的共同祖先是无甲亚纲。
B. 爬行类由古两栖类的坚头类（石炭纪末）演化而来（在古炭纪末期，地球发生强烈的造山运动，是气候变干燥甚至沙漠，使大量两栖类灭绝或是重新回到水中），最原始的爬行类是杯龙类（蜥蜴等），由杯龙类演化出的两大类群，即始鳄类（古生代二叠纪，大部分便是现代爬行类，除了鱼龙类）与盘龙类（石炭纪末期至二叠纪）。
C. 鸟类在中生代侏罗纪从假鳄类演化而来，即起源于晚侏罗纪的小型兽脚类恐龙，始祖鸟和原鸟既有爬行类的特征也有鸟类的特征，是爬行类的向鸟类的过渡类型。现存鸟类是平胸总目、企鹅总目、突胸总目。
D. 爬行类中盘龙类后代中一支叫兽齿类，具有哺乳类的特征，是哺乳动物的原祖。原兽亚纲（鸭嘴兽）是现存哺乳类中最原始的类群，具有一系列接近于爬行类和不同于高等哺乳类的特征；后兽亚纲（灰袋鼠）是比较低等的哺乳类，高等哺乳类群是真兽亚纲，分为18个目，都为现存种类。
从化石与达尔文进化学说来看，爬行类与现代两栖类都来源于古两栖类，而古代爬行类是现代爬行类、哺乳类和鸟类的共同祖先。从而得到与支序分类学不一样的系统树如下所示：
进化分类学
综上可以看出支序分类学与进化分类学的区别，也使我们更好地掌握动物的系统发育

这是从进化分类学上来讲生物的系统进化.这是我自己以前写的,可能很不全面.

Answer 2

SCIENCE AND PHILOSOPHY OF BIOSYSTEM

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2.3、系统生物工程

生物系统是结构互补而系统分层、功能偶合而界面增长、协同演变而全息对称的自组织信息系统。生物系统科学探讨分子、细胞、器官、群落等各层次系统的结构、图式等原理与应用，尤其是心智、遗传信息系统与医药学、电脑技术研究，采用实验分析、系统逻辑的双重方法论。坎农、贝尔纳从体液稳态机理，最早发展了系统思维，20世纪，实证科学、分析哲学发展到系统科学、综合哲学。系统生物科学，开创于贝塔郎菲的理论生物学和一般系统论，包括系统生理学、系统医学、系统生物学等，最早的学科是系统生态学 (System Ecology)。

自组织系统的结构论(Structurity) - 生物系统的泛进化论(Pan-Evolution Theory)，阐述中西文化融合导致生物、心理、医学科学的实验、系统方法论、逻辑学以及系统生物工程(System Biological Engineering)、工业生态(Industrial Ecology)等的发展趋势，生物系统的基因组智能(Genomic Intelligence)与人工生命系统(Artificial Biosystem)的研究，从基因遗传到神经网络体现的是基因组智能的程序化表达过程，还人工生命系统是对遗传程序化表达的仿生工程。采用细胞信号传导路径的基因表达筛选传统天然生药，以及细胞内外信号网络的人工神经元仿生计算，将带来生物系统工业、生物系统农业和生物系统医学的一场技术方法和观念革命。

生物进化(细胞、个体及群体)是模式结构的演变，也就是结构层级的增长、形态结构的适应分歧。从原始细胞的起源到多细胞真核动物，三胚层动物形成了神经、免疫、分泌经由受体、信息分子双相通讯、相互调控，以及消化、泌尿、呼吸与循环动态平衡的系统结构框架。生物神经网络、层次的发育、可塑性调控是行为刺激与多基因联锁、连续诱导的程序表达。经典遗传学探讨物种内几何抽象的连锁基因和等位基因显、隐性排列组合。分子遗传学追踪了基因的本质、重组及表达调控，研究染色体几何位点的基因线性调控蛋白质表达信息传递。物种模式结构是基因组对应生物体的发育控制过程，是细胞类型、数量的时空结构模式，因而，基因组的基因群、基因链、基因族结构和层级，以及基因协同表达的逻辑揭示，基因调控、行为刺激模式构筑神经网络分层、可塑变化发育分析，图式(系统/结构)遗传学才能真正解决物种的基因设计蓝图。

生命系统(遗传、心智)是基因组结构重组和层次演变、神经元可塑结构和网络化分层的功能、信息调控的细胞元自组织化信息系统，自复制、自组装、自学习（适应）的生物系统蕴含着巨大的技术、经济前景和社会、伦理学意义。

最初出现于20世纪60年代的“生物工程学”是指生物医学工程和生物化学工程，主要内容是人工器官和发酵工程。随着细胞杂交、固定化酶技术，70年代科恩、博耶的DNA重组实验， 80年代神经网络计算、生物分子芯片概念的兴起，从而将形成改造和仿造生命的系统生物工业未来。系统生物工程学，主要包括：1)、真核细胞、微生物发酵的生物化学、生态工程，2)、细胞杂交、基因重组、胚胎培养的发育、遗传工程，3)、生物传感器、固定化酶、高分子元件、人工器官、仿生工程，4)、智能工程、神经网络、遗传运算等。乳腺生物反应器、输卵管生物反应器(Oviduct Bioreactor)以及固定化核糖体是生产贵重蛋白药物的核心技术，还DNA分子元件、生物计算机、遗传代数运算将带来的是智能机器人的发展。

21世纪，生物-医学发展到社会-心理-生物医学模式，实验方法、动力原理物理-化学工业转换成为系统方法、有机原理的生物-化学-物理工业，以及人工智能、创造工程、系统管理的工业模式和外太空生物、生命机器(BioMachine)等方面的探索。农业生态工程、工业生态技术是进行城市生态、环境工程(Environment Engineering)无污染、无烟化系统工业循环、再生的重要方法。从英国工业革命到工业网络化、生态化、藕合化，将诞生的是自然、人文、工业之间的协调和谐，系统生物工程将带来工业生态、系统医学、生物电脑的技术革命。

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Answer 3

什么是生物的进化历程