(一)自然地理因素
1.干旱气候是盐碱土形成的重要条件
新疆气候干旱，蒸发强烈，决定了土壤上行水流为主的水分运动，使土壤可溶性盐上升积聚于土壤表层，造成土壤普遍积盐。地层和土壤母质含盐高也为盐碱土形成提供了盐源。
2.封闭式的地貌水文特点是形成盐碱土的强化因素
新疆的河流大多为四周高山环抱的内陆河，都以盆地中心低洼地为归宿，使盐分不断汇集于盆地之中。
3.地表和地下径流是形成盐碱土的主要动力
地表、地下径流流经含盐高地层，溶解并携带大量盐分，使流经地区土壤盐渍化或通过强烈蒸发使土壤表层盐分积聚，形成大面积盐渍土。
4.盐生植物是形成盐碱土的促进因素
其根系在吸收水分和养分的同时，将深层土壤或地下水中的盐分带入体内，残体分解和散落时，将盐分积于表土。
(二)人为因素
灌溉不当引起地下水位上升，是绿洲土壤次生盐渍化的根本原因。
1)渠道和平原水库渗漏大以及农田灌溉采用大水漫灌引起地下水位上升。
2)重灌轻排，排水出路不畅，使地下水位难以降低。
3)上排下灌，恶化的水质进入农田。上游排水就近排入河道，下游再引灌，使盐分重新带入农田。