韭菜是喜冷凉的蔬菜，生长适温为12～24℃。在日光温室内，如果湿度大，光照弱，高温虽然不一定引起韭菜的品质变劣，但温度高时会使韭菜生长过快，叶片细嫩，抗病性降低，容易造成烂韭菜。同时，如果过高温度加上水分不足，还会引起韭菜干尖。因此，严格控制韭菜生长期间的温度，对于保证韭菜健壮生长和防止韭菜烂具有决定性意义。日光温室的温度管理要根据需要和可能来掌握，在清茬和收割后到韭菜还没有萌发出来以前，气温可尽量高些，以气温促地温，力促韭菜尽早萌发。当韭菜长出地面后，温度就必须从严管理。其中第一刀韭菜生长期间，白天温度宜掌握在17～23℃，尽量不超过24℃，更严格的要求是不允许有2～3小时的超过25℃，不允许有1～2小时超过27℃。在以后各刀的生长期间，控制温度的上限均比上刀高出2～3℃，但也尽量不超过30℃。秋冬连续生产的韭菜扣棚初期，外界温度高，室内温度极容易超过温度上限，更需注意控制温度。温度高了还会减少根茎养分的补给，影响下刀韭菜产量和品质。
温度高要通过放风来调节。秋冬连续生产的韭菜在扣棚初期要放底风，但天气转冷后，特别是休眠韭菜萌发后，一般就不再放底风。放底风时冷风直吹韭菜，会造成冻伤，一冷一热也会出现烂韭菜。严冬季节放风只强调开启上风口。如果湿度大、温度高，可以同时开启中部腰风口，这样不仅使湿度降下来，氨气排出去，也可以有效控制温度，对烂韭菜有明显作用。
夜间温度管理也很重要。夜温低，特别是昼夜温差大，极容易造成叶面结霜或形成水膜，为病原菌的萌发侵入创造条件，会引起病害突然发生。因此，韭菜温室的夜温不能太低，第一刀韭菜生长期间，以保持10～12℃为宜，昼夜温差控制在10～15℃的范围内。以后各刀韭菜生产期间，随着白天温度的提高，夜温也要随之调整，但有时外界温度过低，夜温不好保证。所以，要保持较高夜温必须加强夜间保温。
韭菜叶片喜欢干燥，空气湿度不宜太大，一般尽量不使相对湿度超过83%，湿度大了，特别是出现叶面结霜或水膜，很容易引起病害发生。降低湿度的方法是放风排湿。但在冬季进行日光温室放风，一般是以温度为指标进行，只有当温度超过上限指标时才开始放风。控制温室内湿度不使之过高的重点，应放在减少地面水分蒸发和强调保温上，不使夜间温度过低。
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