公司可以就 劳动纠纷 去劳动局申请调解与员工之间的纠纷，不存在是否告的问题，起诉员工的话需要去法院。与劳动者产生纠纷，公司当可以向当地 劳动监察 行政部门进行举报，由劳动监察大队责令改正；劳动监察大队协调不成的，公司可以 申请劳动仲裁 ；用人单位对劳动仲裁结果不服，可以起诉到人民法院，要求 强制执行 。
《劳动争议调解仲裁法》第十条 发生劳动争议，当事人可以到下列调解组织申请调解： （一）企业劳动争议调解委员会； （二）依法设立的基层人民调解组织； （三）在乡镇、街道设立的具有劳动争议调解职能的组织。企业劳动争议调解委员会由职工代表和企业代表组成。 职工代表由工会成员担任或者由全体职工推举产生，企业代表由企业负责人指定。企业劳动争议调解委员会主任由工会成员或者双方推举的人员担任。