灭绝为何痛恨明教？灭绝为何做了掌门。两个问题，分开回答。
灭绝师太痛恨明教，一为公，二因私
在金庸笔下，起源于波斯的明教本名摩尼教，其教义是惩恶扬善度化世人，因此每逢乱世，明教都会带头跟朝廷为敌，跟一般的门派想要称雄武林的目标并不一样。
正因为明教的这种传统，不断收到朝廷围剿，为躲避官衙，明教中人往往行事诡秘，因此被江湖中所谓的名门正派称作是“魔教”。
其实，不仅仅是灭绝师太，江湖中几乎各大门派都痛恨明教，这是个普遍现象。
在《倚天屠龙记》中，成昆暗中不断挑起纷争，金毛狮王大肆残害武林中人，加上青翼蝠王的恶名，使得明教的“魔教”之名更加坐实，引起了各门各派的攻击。
虽然各大门派都很不喜欢或者厌恶痛恨明教，但像峨眉派灭绝师太这般程度的比较少见，而这主要也与灭绝师太自身的经历有关。
一，孤鸿子之仇
孤鸿子是灭绝师太的师兄，也是峨眉派当年的大师兄，曾经与明教光明左使者杨逍相约比武，为了获胜还特意借来了倚天剑，没想到倚天剑尚没出鞘，孤鸿子就被杨逍击败。
杨逍将倚天剑夺走之后，冷笑道：“倚天剑好大的名气，在我眼里，却如同废铜烂铁一般。”随即将倚天剑仍在地上离去，孤鸿子被活活气死。
在连载版之中，孤鸿子与灭绝不仅是师兄妹，而且互相暗生情意，欲定终身，换言之，孤鸿子就是灭绝师太的情郎，他死后灭绝出家，如此深仇，怎能不恨。
二，纪晓芙事件
还是因为杨逍，纪晓芙遇上杨逍之后，委身于他并且生下了女儿杨不悔，灭绝师太在蝴蝶谷见到了失踪多年的纪晓芙，知道了此事怒不可遏。
灭绝师太要求纪晓芙去刺杀杨逍，表示若她同意，一切既往不咎，还传位给她，但纪晓芙宁死不肯，最终纪晓芙被灭绝师太所杀。
为了杀杨逍，灭绝竟能容忍纪晓芙的所有错失，可见孤鸿子之仇在她心中的分量，而纪晓芙本来是她最中意的传人，结果变成这样，灭绝师太对杨逍对明教的恨愈发加深。
三，方评之仇
在原著之中，灭绝师太出身河南开封的方家，除了她之外，还有个兄长叫做方评，人称“金瓜锤”，虽然也是武林中人，但方评平日极少与人来往，只是读书种田。
然而，在混元霹雳手成昆的布局之下，方评被金毛狮王谢逊所害，这对灭绝师太造成了极大的打击，也为日后灭绝师太绝情绝义、宁死不折的性格产生了巨大影响。
虽然灭绝师太已经出家，但是方评终究是她的哥哥，何况方评又是死在明教护教法王谢逊的手中，使得灭绝师太对明教更加深恶痛绝。
不仅如此，因为纪晓芙的死，杨逍将这笔账全都算在了峨眉派的头上，加上成昆的暗中安排，多年里，以代教主身份执掌明教的杨逍，对峨眉派各种追击，无形中加剧了这种怨恨。
灭绝、灭绝，全灭断绝，作为一个出家人，灭绝师太的法号之中，透露出的戾气实在不是一般的重，而这从侧面也反映出，她出家的目的极可能就是心中的恨。
于公，明教是武林公敌，灭绝师太也是武林“正道”之一，她敌视明教无可厚非，
于私，她的师兄、爱徒、亲人，全因明教而故，如此深仇，让灭绝师太更恨明教。
灭绝师太成为峨眉掌门的原因
其实，峨眉派并非都是女子，也并没有掌门必须是女子的明规，但 灭绝师太的师傅风陵师太当年，并没有将掌门之位传给武功更高的大弟子孤鸿子，而是传给了灭绝。
论武功论资历，灭绝都不如孤鸿子，为何灭绝成了掌门？
一，女子做掌门的传统
金庸原著里的峨眉派也有男弟子，而且当年孤鸿子的武功也极高，可见男子在峨眉派原本的地位还是比较高的，只因后来灭绝不喜男弟子，因此男弟子在峨眉势微。
尽管峨眉没有必须要女子做掌门的规矩，但无论是郭襄还是风陵师太，她们都是女子而且都出了家，很可能这在峨眉成了一项不成文的规矩。
虽然灭绝是孤鸿子的师妹，但她的武功与资历在峨眉派中都相当出挑，风陵师太也很满意，因此将倚天剑与掌门之位传给了灭绝。
二，灭绝师太的性格更合适做掌门
峨眉派的开创者郭襄是郭靖的小女儿，当年襄阳城破，郭襄带走了倚天剑，一直都想找到屠龙刀，以取出刀剑之内的武功秘籍和武穆遗书，击退元兵恢复汉家山河。
在六大门派之中，可以明显看出，以女子为主的峨眉派，却是抗元意识最强，意志力最坚定的一个，而峨眉派掌门灭绝师太，就是抗击元兵的典型代表。
风陵师太看准了灭绝的性格，认为只有她做掌门，才能将峨眉派祖师郭襄的遗志继承，并且让峨眉武功光大，而被杨逍气死的孤鸿子，显然性格有缺，不适合担任大务。
