西医在传入中国时，其本身进入“临床医学“也只有半个世纪的时间，在其与中医缓慢的冲突与融合过程中，西医内科才开始因为”细菌“的发现而真正进入近代化阶段。相较于”近代化“的西医，在当时，与“中医”的差别，并非人们想当然的认为是“疗效”或者“科学”，而更偏向于“技术”和“制度”，主要有以下几个方面组成。
一、临床医学
临床医学相较于传统医学有三个显著特征，一是医学的研究对象，从以前的“人”的整体，变成了“疾病”本身，二是医学教育不再是依靠背诵大量经典文献，而变成大量的临床实践，三是，医学教育世俗化。
19世纪五十年代，英国通过了一项法律，规定任何没有获得资格认证的行医者，不得冒充“严格意义”上的医生。从此病人在看病时，只要核实此人的资格证书，就可以判断此人是否具有足够的行医资格。
而其实在此之前，行医资格证书就已经在德国、法国、英国出现，医生需要通过特定的“医学团体“的训练和测试，方才能得到资格证书和会员资格，这个特殊的训练和测试，与”临床医学“的诞生离不开干系，在当时，最好的医学院和最好的医院是一体的。
西医的”资格认证“，是西医进入中国时，以压倒性优势打败中医的重要原因，西医最早进入中国的医生，也就是所谓的”医学传教士“，但他们都是经过正规医学训练，获得医学资格证书的医生。最早进入中国时，西医内科还停留在发烧感冒吃奎宁的阶段，但仅仅“外科手术”这一项，就灭掉了绝大多数中国医生，更别说其专业的研究态度。
1842年《关于英国劳动人口的卫生状况报告》的发表是英国”公共卫生体系“建立的基础，而这个”公共卫生体系“，是标准的近代化产物，是在"城市化“进程中，面对以前所没有大规模人口聚集所引起的公共卫生危机，而产生的一种应对机制。
中国的近代化城市于十九世纪末二十世纪初兴起，其模式基本都是引进自西方，当时西方已经有了较为完备的公共卫生体系，所以在进入中国时，这个体系也自然被带入进来，只是，却只能在较为发达的城市施行，而在广大矿山工厂，公共卫生事故和公共安全事故，到现在都是中国人的痛吧。
总体来说的，中医其实更适合调理身体一类，西医更适合治疗一些急性疾病或难以根治的的疾病。西医的传入对我国医药卫生事业发展无疑是利大于弊的，促进了我国医疗卫生事业的巨大进步。