what do you mean？你什么意思？
这是一个疑问句，所以句子要把be动词/助动词这些提到主语前面。因为mean是动词所以要借助助动词。如果把do改为are，那句子就有两个动词了，这不符合语法规则噢。
are后面可以加形容词，to do，doing......，但是一般是没有加动词原形。
mean的词义：
v. 意思是；表示…的意思；本意是；打算；意欲；有…的目的；想要某人成为；产生…结果；对某人重要（或有价值）
adj. 吝啬的；小气的；不善良；刻薄；要发怒的；要发狂的；熟练的；平均的；平庸的；低劣而肮脏的；出身卑贱的
n. 中间；中庸；折中；平均数；平均值；算术中项