与一代、二代测序相比,单分子测序技术的优势：由于单分子测序具有通量更高，仪器和试剂相对便宜、操作简单等的优势而比第二代测序技术有更广阔的应用空间。
第一代指双脱氧末端终止法，扩增后通过毛细管电泳读取序列，每次获取数据量少。第二代为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。
利用DNA聚合酶合成
与模板互补的DNA链， 在三维空间中记录模板位置和核苷酸序列信息， 再反向构建DNA模板的序列。除了DNA合成反应的三大要素（模板、酶、核苷酸）之外， 模板所处位置和反应循环中单色荧光标记的核苷酸顺序(如A、C、G、T )也是最终DNA序列能够完成的关键要素。如果反应所用的核苷酸标记着四种不同的荧光， 则每一次反应循环就需要切换不同波长的光以记录不同的碱基。
以上内容参考：百度百科-单分子测序
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