一、苹果在长期的营养繁殖过程中，病毒的侵染逐年积累增多。苹果树一旦被病毒侵染，就终生带毒，持久危害。
二、苹果病毒主要通过嫁接传染，随同接穗〔或砧木〕、苗木远距离传播。因此，嫁接繁殖的数量越大，病毒的传播速度也越快。
三、病毒病害与真菌或细菌病害不同，难以用化学药剂进行有效的预防或控制，培育和栽培无病毒苗木是防治苹果病毒病的根本途径。
四、果树受病毒侵染后，病毒主要在细胞内寄生和增殖。因此，全身各部位都带有病毒，破坏、干扰树体正常生理机能，导致长势减退，产量下降，品质变劣，直至全株死亡。
苹果病毒按其危害特点，可分为非潜隐病毒和潜隐病毒两大类。苹果非潜隐病毒侵染苹果树后，大部分栽培品种都有明显症状，病树容易识别，无需特殊鉴定，只根据症状特点，即可辨认。例如，我国发生的苹果花叶病和苹果绿皱果病就是由非潜隐病引起的。而潜隐病毒在栽培品种上不表现明显的症状，必须经过鉴定才能明确苹果树的带毒状况。各国研究表明大多数苹果栽培品种，都感染一种乃至数种潜隐病毒，其中以苹果退绿叶斑病毒、苹果茎痘病毒和苹果茎沟病毒分布最广，危害性最大，几乎在所有栽培苹果的国家或地区都有存在。从生产实际来看，苹果病毒分布之广，危害之重，不亚于真菌所致的树皮腐烂病和果实腐烂病。
我国苹果栽培各地主要品种几乎都潜褪绿叶斑、茎痘和茎沟3种病毒。这几种病毒，在砧木不抗病的情况下，会形成衰退病或苗木嫁接不成活等急性危害，防治上只要改换抗病砧木就可基本解决问题。但是解决潜隐病毒的慢性危害，则必须从砧木和接穗两方面入手。已报道的30多种苹果病毒中，还未发现虫传病毒，也未发其他传毒媒介。苹果病毒病目前尚无有效治疗方法，因此，培育采穗用的无病毒母本树，繁殖栽培无病毒苗木，是防治苹果病毒危害的根本措施。
药物防治：
方案一 叶面喷施病毒1号，在果树花露红期喷洒第一遍药375倍，并在药液中加0.5kg鲜牛奶；在谢花后7天左右再喷施第二次375倍，加0.5kg牛奶；套袋之前喷施第三次375倍加0.7kg牛奶；病情严重时，在夏至后至秋分前（这个时期是形成明年所有花芽和叶芽的关键时期），一般是7月中旬前后再喷施第四次375倍加0.7kg牛奶。
方案二 叶面喷施病毒2号，分别在果树花前、 花后、 套袋前，将病毒Ⅱ号按300—500倍液稀释，同时添加纯牛奶0.5kg，进行喷施。土壤处理：分二个时间段：(1)果实采收后至落叶前；(2)树液流动后至开花前。用TY病毒2号按500倍液灌根，每株浇灌药液50～60斤。采用放射状施用方法(3-5年生树体，挖 4-5条放射沟，成年树，挖6-8条放射沟)。
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