两个皇帝分别是 ：爱新觉罗·载淳（同治帝）和爱新觉罗·载湉（光绪皇帝）。
慈禧即孝钦显皇后，叶赫那拉氏，咸丰帝的妃嫔，同治帝的生母。晚清重要政治人物，清朝晚期的实际统治者。
1861年咸丰帝驾崩后，与孝贞显皇后两宫并尊，称圣母皇太后，上徽号慈禧；后联合慈安太后（即孝贞）、恭亲王奕欣发动辛酉政变，诛顾命八大臣，夺取政权，形成“二宫垂帘，亲王议政”的格局。清政府暂时进入平静时期，史称同治中兴。1873年两宫太后卷帘归政。
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1861年12月2日，改年号“同治”，两宫太后御养心殿，垂帘听政。
同治十一年（1872年），载淳已17岁，慈禧不得已为他选后，次年，两宫太后卷帘归政。但同治帝亲政后仍难摆脱慈禧的干预。
1875年同治帝崩逝，择其侄子爱新觉罗·载湉继咸丰大统，年号光绪，两宫再度垂帘听政；1881年慈安太后去世，又因1884年慈禧发动“甲申易枢”罢免恭亲王，开始独掌大权；1889年归政于光绪，退隐颐和园；
1898年，戊戌变法中帝党密谋围园杀后，慈禧发动戊戌政变，囚光绪帝，斩戊戌六君子，再度训政；1900年庚子国变后，实行清末新政，对兵商学官法进行改革。
参考资料：百度百科-慈禧
慈禧控制的是同治与光绪两个皇帝。
慈禧为咸丰皇帝妃嫔，1861年咸丰帝驾崩，授命八大臣辅佐新帝，后来大权掌握在这八个大臣手中。慈禧联合慈安皇后、恭亲王奕欣发动辛酉政变，诛顾命八大臣，夺取政权，形成“垂帘听政”的格局。清政府暂时进入平静时期。
1875年同治帝崩逝，载湉继位，即光绪皇帝，光绪年仅四岁，两宫再度垂帘听政；1881年慈安太后去世，1884年慈禧发动“甲申易枢”罢免恭亲王，开始独掌大权；1889年归政于光绪，退隐颐和园；1898年，戊戌变法，慈禧发动戊戌政变，囚光绪帝，斩戊戌六君子，再度训政。
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同治帝载淳和光绪帝载湉是堂兄弟关系，也是表兄弟关系。
同治皇帝载淳的父亲是咸丰皇帝奕詝，光绪皇帝载湉的父亲是醇贤亲王奕譞。奕詝为道光皇帝第四子，而奕譞为道光第七子，所以同治与光绪的父亲是亲兄弟，从父亲这边算，他们俩是堂兄弟。
同治皇帝的母亲是慈禧太后叶赫那拉氏杏贞，光绪皇帝的母亲是醇亲王福晋叶赫那拉婉贞，杏贞与婉贞都是叶赫那拉惠征之女。杏贞通过选秀入宫，步步高升成为懿贵妃后，婉贞也参加选秀，落选，被指定配予奕譞为嫡福晋。所以从母亲的角度，同治与光绪是表兄弟。
同治帝十九岁早逝，咸丰皇帝一脉无后，慈禧选定了自己妹妹的儿子载湉，从私心来说，一来是载湉年仅四岁，可以由她继续把持朝政，二来载湉关系相比其他皇室子弟与她更亲近，是自己的亲外甥，所以选定了载湉。
参考资料：百度百科－慈禧
清穆宗爱新觉罗·载淳（1856年4月27日－1875年1月12日），清朝第十位皇帝，也是清军入关以来第八位皇帝，年号“同治”。咸丰六年（1856年）三月二十三日（公历4月27日）生于北京紫禁城储秀宫，为清文宗咸丰帝长子，生母为孝钦显皇后叶赫那拉氏。1861年—1875年在位，在位13年。
清代末年，垂帘听政制度发展到了鼎盛时期，形成为一套严密、系统、完善的政治体制。慈禧太后的垂帘听政，在历史上最为著名，也是中国封建社会最后一个女主执政，在当时的政治舞台上也导演了惊心动魄的一幕。后来“戊戌变法”失败，光绪被囚，老慈禧第三次临朝称制，前后共掌握清代朝政达48年之久。随着清王朝的覆灭，延续了两千余年的垂帘听政制度也就寿终正寝了。本回答被网友采纳