喀什机场位于喀什市西北方，距市中心9公里。该机场飞行区等级为4E，可起降波音747-400型以下客机，同时还具有定期国际航班备降的职能。 目前，南航新疆公司执行乌鲁木齐——喀什航班，每周14班。伊宁——乌鲁木齐——喀什航班，每周4班。 伊宁机场位于伊宁市东北方，距市中心5公里。该机场飞行区等级为3C，可起降波音737-700型以下客机。 目前，南航新疆公司执行乌鲁木齐——伊宁航班，每周14班。伊宁——乌鲁木齐——喀什航班，每周4班。 库尔勒机场拟迁建，迁建后的库尔勒机场位于库尔勒市西南方，距市中心17公里。该机场为军民合用机场，民用部分飞行区等级为4D，总投资4.4亿元。 目前，南航新疆公司执行乌鲁木齐——库尔勒航班，每周7班。乌鲁木齐——库尔勒——且末航班，每周7班。 阿克苏机场位于塔里木盆地北沿，天山南麓，为天然戈壁滩，自西南（206）至（86）度，20千米以外为山区，其它方向平坦，机场以北2千米处有乌—喀公路通过，西和西南为库马里西克河及阿克苏河，机场距乌鲁木齐直线距离700公里，公路距离1000公里，离阿克苏市12.5公里，温宿县城5公里。 阿克苏机场建于1966年，原为空军机场，1973年民航进驻，占地面积约4600亩，机场水泥跑道长为2400米，宽45米，厚18公分。跑道符负荷40吨以下机型，停机坪有两个停机位。还架设了钢排网，跑道实行全封闭运行。机场候机楼可同时容纳150人同时候机。 和田机场位于和田市西南方，距市中心11.5公里。该机场为军民合用机场，自2002年6月起进行扩建，民用部分飞行区等级为4D，可起降波音747-200型以下客机。 目前，南航新疆公司执行乌鲁木齐——阿克苏——和田航班，每周4班。乌鲁木齐——库车——和田航班，每周7班。 阿勒泰机场位于阿勒泰市西南方，距市中心10公里。该机场飞行区等级为3C,可起降波音737-700型以下客机。 目前，南航新疆公司执行乌鲁木齐——阿勒泰航班，每周7班。 且末机场位于且末县城北方，距城中心1.2公里。该机场飞行区等级为3C，可起降ATR-72型以下客机。 目前，南航新疆公司执行乌鲁木齐——库尔勒——且末航班，每周7班。 库车机场位于库车县城东北方，距县城中心2.1公里。该机场飞行区等级为3C，可起降ATR-72型以下客机。 目前，南航新疆公司执行乌鲁木齐——库车——和田航班，每周7班。 塔城机场位于塔城市东，距市中心28.5公里。该机场飞行区等级为3C，可起降ATR-72型以下客机。 目前，南航新疆公司执行乌鲁木齐——塔城航班，每周4班。 以及喀纳斯机场,克拉玛依机场,哈密机场.
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