1、增值税的缴纳
根据《财政部、国家税务总局关于进一步明确全面推开营改增试点有关劳务派遣服务、收费公路通行费抵扣等政策的通知》，纳税人以经营租赁方式将土地出租给他人使用，按照不动产经营租赁服务缴纳增值税。
不过在《财政部、税务总局关于建筑服务等营改增试点政策的通知》中也表示，纳税人采取转包、出租、互换、转让、入股等方式将承包地流转给农业生产者用于农业生产，免征增值税。
由此可见，农户土地流转只有用于农业生产的，免征增值税，用于非农业生产的，应当按照不动产经营租赁缴纳增值税。
2、印花税缴纳
在印花税税目表的“财产租赁合同”税目中并没有列举土地使用权租赁项目，因此，土地租赁合同不属于应税凭证，无需贴花。
3、个人所得税缴纳
《财政部、税务总局关于农村税费改革试点地区有关个人所得税问题的通知》规定，个人或个体户从事种植业、养殖业、饲养业、捕捞业取得的所得暂不征收个人所得税。
农民取得的土地流转费和青苗补偿费属于同一性质，在政策没有明确文件征收个人所得税前，不应对这部分收入征收个人所得税。
4、土地使用税缴纳
《财政部、税务总局关于集体土地城镇土地使用税有关政策的通知》中规定，在城镇土地使用税征税范围内实际使用应税集体所有建设用地、但未办理土地使用权流转手续的，由实际使用集体土地的单位和个人按规定缴纳城镇土地使用税。
因此，承租人租用农民土地，若该土地位于城市、县城、建制镇、工矿区的，应缴纳土地使用税。土地使用税实际占用的土地面积为计税依据，依照规定税额计算缴纳。
但是如果土地是位于城市、县城、建制镇、工矿区以外的，不征收土地使用税。
5、土地增值税缴纳
土地增值税仅对转让国有土地使用权的征收，对转让集体土地使用权的不征税。
6、耕地占用税缴纳
《耕地占用税法》(令第十八号)第二条规定：“在 境内占用耕地建设建筑物、构筑物或者从事非农业建设的单位和个人，为耕地占用税的纳税人，应当依照本法规定缴纳耕地占用税。”
耕地占用税属于行为税，与纳税人是否取得土地使用权没有关系。
但对农用地建设直接为农业生产服务的生产设施的，不缴纳耕地占用税。
对农村集体土地承包经营权流转后仍用于农业生产的，只是承包经营权的转移，不属于契税的征税范围，不缴纳契税；如用于非农业生产的，应按土地使用权转让征收契税。
《中华人民共和国契税暂行条例》(国务院令1997年第224号)
第一条规定，在中华人民共和国境内转移土地、房屋权属，承受的单位和个人为契税的纳税人，应当依照本条例的规定缴纳契税。
第二条规定，本条例所称转移土地、房屋权属是指下列行为：
(一)国有土地使用权出让;
(二)土地使用权转让，包括出售、赠与和交换;
(三)房屋买卖;
(四)房屋赠与;
(五)房屋交换。
前款第二项土地使用权转让，不包括农村集体土地承包经营权的转移。
《中华人民共和国契税暂行条例细则》第三条规定，条例所称承受，是指以受让、购买、受赠、交换等方式取得土地、房屋权属的行为。
根据上述规定，除农村集体土地承包经营权的转移外，农民集体所有的土地权属转让和农村房屋权属转移，应按规定征收契税。契税应由受让、购买、受赠、交换等方式取得土地、房屋权属方缴纳。
“土地承包经营权流转”，指的是在农村土地承包中的物权性质土地承包经营权有效存在前提条件下，在不改变农村土地所有权权属性质和主体种类与农村土地农业用途的基础上，原承包方依法将该物权性质土地承包经营权或者从该物权性质土地承包经营权中分离出来的部分权能等具体民事权利转移给他人的行为。
《农村土地承包法》第三十二条规定，通过家庭承包取得的土地承包经营权可以依法采取转包、出租、互换、转让或者其他方式流转。其他方式主要指入股。该法第三十一条规定：“林地承包的承包人死亡，其继承人可以在承包期内继续承包。” 据此，农村土地承包经营权流转形式主要有：转让、转包、出租、互换、入股、继承等。本回答被网友采纳