对一个武将而言，能力是综合的。有自身武功、兵法谋略、治军统兵等多方面能力。
看楼主的意思，是要武力值的排名了。
楼主既然明白演义的情节不可取，那更好，省了我解释历史和演义的区别了。
本人不敢说通读三国史书，但敢说三国志、裴注、魏书、曹瞒传、资治通鉴等书都读过。
以我读过的感受，三国将领，武功是次要的。
真正的大将，要的还是统兵打仗能力。
虽然也有亲自上阵杀敌的，但多是为了鼓舞士兵的士气，而不是真的以一敌千。演义毕竟太夸张了。
但可以肯定，将领们必定都是武功不错的。虽然不是最重要的一项，但却是必要的一项。
以武功而言，以我感觉，第一应该是文鸯。
楼主你看过文鸯的史料吗？
这个家伙，简直不是人！！！
我把史书中的记载给你翻译成白话，你看一下：
“司马师在汝阳，看到叛军的窘境后又给他们设下了圈套。邓艾将毋丘俭的使者斩首后，立刻带着一万多人先占据了乐嘉城这一要地。司马师这时命令邓艾示弱诱敌，文钦果然带兵来争夺。司马师却偷偷从汝阳带领大军驰援。文钦看到司马师的人马后才知道上了当，惊慌失措。然而，他仅仅十八岁的儿子文鸯初生牛犊不怕虎："趁他们刚来立足未稳，不如半夜突击。"于是文钦父子分兵两路，夜里文鸯突然就冲进了司马师的大营。司马师听到军营遭受奇袭，大吃一惊，他那本来就长着肉瘤的眼睛居然掉出了眼珠。他紧紧咬住被子强行忍住剧痛，以至于被子都被咬破。而文鸯奋战一夜却没有等到父亲的接应，天亮后他看到司马师大军势头太猛也只好突出重围。司马师当即就命令大家将剩勇追穷寇。文鸯看到有追兵，估计如果不能先将其挫败是逃不了了，带着十几名骁勇的骑兵反复冲杀，硬是把追兵打退。司马师再次命令八千骑兵追击，也被文鸯一个人反复冲杀六七次，每次都杀伤一百多，终于逼退了追兵。”
赵云长坂坡很英勇吧，可惜并没有历史根据。
而这个文鸯的事迹可是史书上白纸黑字记载的清清楚楚，他简直不是人啊。
第二是谁？说实话不好排。
因为历史上是很少见阵前单挑的。不单挑就不好判断谁高谁低。
但我们可以根据记载和逻辑进行推测。
我觉得第二不应该是一个人，而是一类人——保镖类。
前面说了，将领首要的能力不是武功，是统兵作战能力。
而保镖就不一样了，首要能力是武功。打架厉害才配当保镖。
所以，那些专业保镖，以及曾经当过保镖的人，其武功应该普遍比纯将领要高一截。
比如曹操的保镖，典韦、许诸。这两人统领虎卫军，专业保镖。虎卫军是什么？就是曹操的专业保镖队，而典韦、许诸就是一代队长和二代队长。
这个虎卫军里，全是打架厉害的武功强人，而典韦、许诸就是强人中的强人。
典韦，其事迹被后世传唱，难得的是，其事迹大部分都见于史书记载。比起赵云、诸葛亮等人，典韦显得较为真实。要知道赵云他们的事迹，十有八九是演义出来的，而典韦的事迹大部分都是有史实记载的。建议楼主是读一下三国志·典韦传，很精彩，我每读一次都感叹一次典将军的勇猛。
许诸，典韦死后成为虎卫军的二代队长，这个职位本身就是对武功的肯定。史书还记载许诸拽着牛尾巴倒行百余步。不说别的，仅这力气就足够吓死大多数人了。
还有些保镖（或武将兼职保镖），比如周泰、赵云、胡车儿等。
说说周泰吧。
此人多次救孙权性命，都是冲进乱军不要命的砍杀，全身刀伤不计其数。
要知道，那是乱军砍杀啊，长枪大戟的玩命那种，不是街头小混混拿片刀砍人。在这种情况下，周态还能救下孙权（孙权自己都已经绝望了），可见武功够强。尤其是全身上下伤处无数，但他却没死，也没残疾，这说明什么？除了武功高以外，还说明了一点，这哥们肌肉一定很厚很厚！！！没有足够厚的肌肉，不死也残废了。
还有赵云。虽然我们知道他的事迹多为演义的，但不可否认，他确实兼职过刘备的保镖工作。
保镖二字就是武功的证明。
而且刘备封四大将军时，虽然赵云无名（演义中改成了五大将军，硬加入赵云成了五虎上将），但他的职位是中护军。这个中护军的职责选拔武将官员。看看，选拔嘿嘿~~~比如说考考这个考生的武功吧，那么首先赵云自身的武功要高。自身高才有资格去考别人。当然，选拔官员不是只考武功的，但应该是必有这一项。
顺便说一下，赵云当刘备的保镖，那是兼职。刘备的正职保镖是个叫陈到的人。此人武功应该很强的，只可惜三国演义里没有这人，被作者完全删除了。所以知道的人不多。
这类保镖人材，还有一些，楼主可以去史书上发掘一下。本人是纯手打的，没有复制粘贴，很累的，这里就不多说了。起个抛砖引玉的作用，楼主自己斟酌吧。
第三类才是那些专业的武将们。
包括那个“所谓的第一”吕布，其实都应该归到第三类里。
像关羽、张飞他们这些人也不例外，都在这一类。
参考资料：http://zhidao.baidu.com/question/190947541.html