你好
1、首先确认一点，你已经取得【在留资格认定证明书】，也就是常说的“反签证”。如果已经拿到，请继续看。。如果还没拿到，现在还不是讨论签证的时候。
2、如果你的户口实在山东省，那么需要通过日本驻华大使馆指定的【代理机构】向日本驻华大使馆领事部申请签证，所需材料既可以在日本驻华大使馆网站查询到也可以在代理机构处得知。如果户口不是山东的，那么就要到日本大使馆网站查询应该到哪个使领馆办理。
3、所需材料：：【护照】【在留资格原件复印件】【户口本复印件（首页、经费支付人、本人）】【毕业证复印件】【在职证明（日期在3个月以内的）】【签证申请书（使馆网页下载）】【留学生调查表（使馆网页下载）】【照片（贴在签证申请书上，2寸白色背景）】。
4、期限：4个工作日----也就是说递交到使馆7天后出结果给代理机构。（递交日不算，加上周末两天，合计7天）
5、费用：使馆收200元，代理机构收200-300元，合计500元以内。是交给代理机构的。
6、为什么要通过代理机构？因为日本驻华使馆明确规定，【本馆的签证手续原则上需要通过本馆指定的代办机构办理。「外交」、「公务」、「因公普通」护照持有者必须通过中华人民共和国外交部指定的代办机构办理。另外，国费留学生和在中国长期居留的日本人的配偶的同伴签证请直接与本馆领事部签证处联系。】估计你是持有【普通P】护照的私费留学生，因此，只能通过代理机构申请。
7、日本驻青岛总领事馆为什么不行？因为他们现在还没有开展留学签证的审核业务，山东省持在留资格的签证申请者仍需要向北京的日本驻华大使馆申请。
8、更多信息请到日本驻华大使馆网站查询。
---非专家
追问非常非常的感谢，如果我是作为国家间合作培养项目公费留学的话，签证是不是会好办些，因为我不会日语，英语水平也一般。
追答是的，公派留学不存在签证难度。
如果？
参考资料：http://www.cn.emb-japan.go.jp/consular/visa_shikaku.htm