云南大学的优势专业主要集中在法学（民族学、政治学、马克思主义理论）、经济学（理论经济学）、历史学（中国史）、理学（生态学、生物学、数学、统计学）、工学（计算机科学与技术、软件工程）、管理学（图书情报与档案管理、工商管理）等几个大类中。其中，民族学是云南大学两个世界一流学科建设学科之一，云南大学的民族学学科与中央民族大学在学科排名中并列全国第一。生态学学科并列全国第6、政治学学科并列全国第8、图书情报与档案管理学科并列全国第8、生物学学科并列全国第17、中国史学科并列全国第17、理论经济学学科并列全国第19。