注册公司认缴和实缴的主要区别如下：
认缴是指公司在注册时，股东承诺要出资的金额，也就是公司注册资本的理论数值。股东无需在注册时一次性缴纳全部出资，而是按照公司章程规定的出资期限逐步缴纳。这种方式降低了公司的创业门槛，有助于鼓励企业投资。
实缴则是股东按照公司章程或约定，实际已经缴纳到位的注册资本金额。也就是说，实缴金额是已经实际进入公司账户并作为公司资产的部分。公司的实缴资本反映了公司的实际资本实力和偿债能力。
具体到两者的差异：
1. 资金流动与风险：认缴制度下，资金尚未全部到位，可能存在资金流动风险。实缴则意味着资金已经到位，企业的偿债能力和经营能力相对较强。因此，在某些情况下，合作伙伴或供应商可能更倾向于与实缴资本较高的公司合作。
2. 注册门槛与灵活性：认缴制度降低了创业的门槛，允许创业者根据项目的发展逐步投入资金。而实缴则要求股东一次性投入约定的资本，对于资金不足的创业者来说压力较大。此外，在股东撤资的情况下，认缴制度允许更大的灵活性，而实缴则需遵守严格的法律程序。
3. 法律效应与责任明确性：尽管认缴资本为企业带来更大的自主性和灵活性，但对于某些合同要求以及涉及到特定资格认定和某些业务领域来说，企业实缴资本的大小直接关系到其能否满足特定要求或参与某些业务活动。因此，在这些场景下，实缴资本的法律效应和责任明确性更强。
总的来说，认缴和实缴在公司的不同阶段和发展计划中有着不同的重要性。在选择认缴或实缴时，企业需要根据自身的需求和经营计划来做出决定。