康敏元益生菌的主要配方独特且具有针对性，主要成分包括专利抗敏益生菌唾液乳酸杆菌（专利编号：LactobacillusSalivarius PM-A0006）。这种益生菌能够直接提升身体环境的适应力，其专利菌株具有高效抗过敏能力，高浓度的菌株数量有助于提高抗敏效率。低聚果糖（Oligosaccharide）作为辅助成分，可以迅速滋养益生菌，调节生理机能，为益生菌的活力提供充足养分，增强其活性。
辅配方中，奶酪粉（带有酸奶风味）和牛羊乳酸菌的加入，进一步促进肠道内益生菌的增长，提升益生菌的整体活性，有助于维持肠道健康。
对于第二代加强型康敏元益生菌，配方有所升级。除了原有的抗过敏益生菌，如唾液乳杆菌、格氏乳杆菌、约氏乳杆菌，还加入了副干酪乳杆菌Lactobacillus paracasei和罗伊氏乳杆菌Lactobacillus reuteri，这几种菌株组合为更全面的益生元保护，旨在提供更全面的免疫支持。
此外，辅配方中还包含了木寡糖和低聚果糖，这两种膳食纤维有助于益生菌在肠道内的存活和繁殖，强化了整体的益生菌生态系统。
康敏元益生菌是经台湾大学医学院、台北荣总医院、台湾成大医学院、台湾慈济医学院四大医学中心多项临床实验证实，专为过敏体质人群配置，有效改善过敏体质，促进营养吸收，提高免疫力的一种国际化新型抗过敏益生菌产品。