合肥学院建筑工程系开设了建筑工程技术专业，专科学制为三年，旨在培养具有全面发展的工程技术人才，以适应社会主义市场经济建设的需求。
这个专业旨在培养具备深厚理论基础和实践能力的学生，他们将掌握建筑工程基础知识，包括建筑结构设计的基本理论和方法，以及施工和造价知识。在学习过程中，学生还将接触建筑经济和管理的基础知识，从而具备初步的建筑工程施工和结构设计能力。
毕业生毕业后，他们的就业方向广泛，主要聚焦在建筑工程的施工、设计和技术管理领域，或是与这些领域相关的技术工作。他们将能胜任建筑工程的施工管理，参与结构设计，并能运用计算机辅助设计进行工作。
课程设置丰富，包括材料力学、结构力学、混凝土及砌体结构、钢结构、建筑结构抗震设计、土力学与地基基础、建筑施工技术、工程造价原理、建筑工程经济与企业管理、计算机辅助设计技术、工程测量技能以及房屋建筑学和建筑材料等相关知识。
合肥学院建筑工程系创建于 1980 年 10 月，其前身是合肥联合大学建筑工程系。现设有土木工程（本科）、工程管理（本科）、房地产经营与估价（专科）和建筑工程技术（专科）共四个专业。本系设有土木工程和工程管理 2 个教研室，现有专兼职教师 30 余人，其中 10 人以上具有副教授以上技术职称，承担全系各个专业的教学工作。在完成教学任务的同时，系里教师还在承担校内外建筑工程设计任务和科研任务。