山东交通学院海运学院的专业设置主要包括航海技术和轮机工程两个本科专业，以及航海技术、轮机工程技术、计算机及应用、船舶制造与修理等四个专科专业。
航海技术专业致力于培养德、智、体、美全面发展的高级工程技术人才，符合国际公约和中国海员适任标准。学生毕业后可在海洋运输、政府机关、研究机构和教育机构从事驾驶、管理、科研或教学等工作。课程包括船舶无线电技术基础、航海气象、航海学等，毕业生可获得国家海事局的相应证书。
轮机工程专业则培养能在现代化船舶机电管理领域具备国际竞争力的高级人才。毕业生适合于政府、企事业单位、研究单位从事管理、维修、科研等工作，课程涵盖机械制图、电工电子学、轮机自动化等，毕业生可获得3000KW及以上船舶三管轮的考试合格证。
山东交通学院海运学院坐落在被联合国誉为“最适合人类居住的城市之一”的美丽海滨小城-------威海市，与刘公岛隔海相看。学院占地面积10万平方米，建筑面积6万余平方米，校园建筑风格独特，环境幽雅，是一所与蓝天为伴、碧海为邻的花园式学院。