截至2020年7月，南通市辖3个区：崇川区、通州区、海门区，1个县：如东县，代管3个
县级市：启东市、如皋市、
海安市。
1、崇川区，隶属于江苏省南通市，位于江苏省中部，
长江入海口北岸，是南通市市委、市政府驻地。总面积234平方千米。根据第七次人口普查数据，截至2020年11月1日零时，崇川区常住人口为1183740人。
2、通州区，江苏省南通市
市辖区，南通市主城区之一，位于江苏省东南部，长江
三角洲东北翼，东临
黄海，西枕长江，东南临海门区，西侧环绕崇川区，西、北与如皋市、如东县接壤。
3、海门区，隶属江苏省南通市，位于江苏省东南部，长江北岸，东北濒临黄海，南靠长江，全境总面积1148.71平方千米，截至2020年6月，海门区下辖3个街道9个镇。海门区人民政府驻海门街道北京中路600号。
4、如东县，江苏省南通市下辖县，位于江苏省东南部、长江三角洲北翼。县境南与通州区为邻，西与如皋市接壤，西北与海安市毗连，东面和北面濒临黄海。
5、启东市，江苏省直辖，南通市代管，位于江苏省东南端，长江入海口北岸，是江苏省日出最早的地方。截至2020年6月，启东市下辖9个镇。面积1208平方千米。根据第七次人口普查数据，截至2020年11月1日零时，启东市常住人口为967313人。
6、如皋市，简称“如”或“皋”，江苏省辖县级市，由南通市代管，江苏省历史文化名城。地处长江三角洲北翼，位于南通、泰州、苏州三市交界处，南与张家港市隔江相望，北与海安市、东与如东县连接、东南与
南通市通州区毗邻，西与泰兴市、西南与靖江市接壤。
7、海安，江苏省南通市代管的县级市，由“海水永不扬波”之意而得名，地处江苏省中南部，位于南通、盐城、泰州三大市交界处；东临黄海，东南与如东接壤，西与泰州市
姜堰区为邻，南和如皋、西南和泰兴相连，北与东台毗邻。