一.办理方式不同。
最早的ETC只有银行能办理，因为以前的ETC是和银行卡绑定的，现在支付宝和微信都是实名制 ，绑定银行卡也是实名制，所以现在支付宝和微信都可以办理ETC了，是一样的。银行ETC就是一张绑定高速公路ETC卡片，开通关联之后，不需要再去ETC里充钱了，会从银行卡内自动扣款，省去了驾驶人去ETC充值的步骤。
1.办理ETC的方式有两种：一种是直接到ETC网点直接办理，另外一种是通过绑定相应银行的信用卡办理;银行ETC指的就是后者。办理银行ETC，车主需遵照银行信用卡消费和还款规定，且
高速过路费直接在关联的银行信用卡上扣除。简单的说，银行ETC就是ETC电子收费系统直接扣除所绑定的银行信用卡内的钱作为过路费的方式。
二.两者有不同的优点和缺点。
银行ETC银行的ETC业务是三者之中最早推出的，在2014年就已经开始推广，基本上全国主要的大银行都会提供ETC服务，银行的ETC设备目前很多都是与信用卡绑定，你办理信用卡，银行即免费赠送ETC设备，客户自主安装即可，ETC卡与客户信用卡绑定，自动扣费，无需充值。
1. 银行的ETC信用卡有几大好处：
(1)部分省份的可以直接用处处理违章记录，比如福建的建行、山东的工行等。
(2)基本优惠为享受9.5折(即100元过路费，只需支付95元)，这个差不多每个银行都有。
(3)额外优惠：比如
广发银行发行的ETC卡，每月消费满3000元，下个月可以享受八折优惠，刷卡加油还可以享受1%的现金返还;比如建行有赠送道路救援险和免费洗车卡等等。
2.支付宝的ETC支付宝的高速ETC服务是2017年推出的，最大的好处就是无需向银行ETC一样绑定设备，直接在支付宝上挂钩你的车辆信息即可，办理支付宝ETC需要
芝麻信用分550分即以上才可以办理。支付宝ETC的优势：
(1)无需和银行一样绑定银行卡，无论是办理还是解绑直接通过手机即可一键办理，方便快捷。
(2)支付宝支持一个账户绑定多辆车，可以为未开立支付宝账户的代付
高速费。
3.支付宝ETC和银行ETC区别介绍。不过优势明显，劣势也很明显：
(1)额度限制，为了保障客户的的账户资金安全，支付宝目前暂时设置的单次车牌付金额上限为100元，如果超过100元的话，还是得使用现金或其他方式。
(2)办理收费，且每次通行都要加收服务费，不仅没优惠，还要额外收费。不过2019年7月1日起应该也要执行95折优惠了，因为上周5月21日的时候
交通运输部下发了《关于大力推广高速公里ETC发展应用工作的通知》，文件中要求加大ETC通行车辆的优惠力度，2019年7月1日起，严格实施对ETC用户不低于95折的通行优惠政策。